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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS运行结果出现nan

改写了一段小的程序,运行计算的时候,屏幕上热力学输出都只显示nan,见附图,这是怎么回事阿?

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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-12-12 11:02:20
引用回帖:
9楼: Originally posted by Bessel at 2012-12-09 22:19:11
create_atoms        1 random 106 16 regbox units box
create_atoms        2 random 106 16 regbox units box

可能问题出在这了,两种粒子都是random分布的,有的可能重合在一起了。所以能量变得无穷大。
...

楼上所言甚是!

如果我没有理解错的话,楼主是想模拟氯化钠晶体的融化吧?

如果是这样的话,你的模型貌似有问题,
create_atoms        1 random 106 16 regbox units box
这个命令建立的原子位置是随机的。而氯化钠晶体中氯和钠的位置可不是这样的。你得根据晶体类型和晶格常数来生成初始位置吧???

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10楼2012-12-09 23:14:20
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-12-11 21:30:01
WJ-MS: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-12-17 09:26:38
我记得这样是初始模型建立的好不引起的。还有把你的 in文件贴出来,让大家看看

你有木有先进行能量最小化?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-12-07 14:04:29
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Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-08 20:08:34
初始构型的问题,在run之前先minimize一下。

http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html

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3楼2012-12-08 04:58:17
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tracel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-08 20:08:51
如前几楼说的,构型不好,导致能量太大,超出了lammps所能记录的数字大小。

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4楼2012-12-08 19:47:03
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