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LAMMPS运行结果出现nan
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WJ-MS
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]
LAMMPS运行结果出现nan
改写了一段小的程序,运行计算的时候,屏幕上热力学输出都只显示nan,见附图,这是怎么回事阿?
Screenshot.png
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加油!
1楼
2012-12-07 11:12:56
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jiaoyixiong
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zh1987hs: 金币+3, 谢谢
2012-12-12 11:02:20
引用回帖:
9楼
:
Originally posted by
Bessel
at 2012-12-09 22:19:11
create_atoms 1 random 106 16 regbox units box
create_atoms 2 random 106 16 regbox units box
可能问题出在这了,两种粒子都是random分布的,有的可能重合在一起了。所以能量变得无穷大。
...
楼上所言甚是!
如果我没有理解错的话,楼主是想模拟氯化钠晶体的融化吧?
如果是这样的话,你的模型貌似有问题,
create_atoms 1 random 106 16 regbox units box
这个命令建立的原子位置是随机的。而氯化钠晶体中氯和钠的位置可不是这样的。你得根据晶体类型和晶格常数来生成初始位置吧???
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WJ-MS
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10楼
2012-12-09 23:14:20
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zh1987hs: 金币+1, 谢谢
2012-12-11 21:30:01
WJ-MS: 金币+3,
★★★
很有帮助
2012-12-17 09:26:38
我记得这样是初始模型建立的好不引起的。还有把你的 in文件贴出来,让大家看看
你有木有先进行能量最小化?
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WJ-MS
2楼
2012-12-07 14:04:29
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Bessel
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2012-12-08 20:08:34
初始构型的问题,在run之前先minimize一下。
http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html
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3楼
2012-12-08 04:58:17
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感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流
2012-12-08 20:08:51
如前几楼说的,构型不好,导致能量太大,超出了lammps所能记录的数字大小。
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WJ-MS
4楼
2012-12-08 19:47:03
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