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amtili

银虫 (小有名气)

[交流] 怎样把material studio中sio2的模型数据导入lammps中 已有6人参与

如题,我知道相关的步骤,在ms中建模(单晶体),进行cvff力的计算,然后导出car文件,然后用命令行转为data文件。
问题是这样操作后的data文件中就有4种原子类型,1,2是si,3,4是氧,在in文件读入数据的时候就会报错,我该怎么处理data,还有相应的in文件该怎么处理?
求指导啊!

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xinmaoqin

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
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jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-07 10:51:51
相应的在in文件中create_atoms 创建四种原子类型,前两种为Si后两种为O
2楼2012-12-07 10:47:11
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amtili

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xinmaoqin at 2012-12-07 10:47:11
相应的在in文件中create_atoms 创建四种原子类型,前两种为Si后两种为O

4 atom types
  
     0.000000000    49.130000000 xlo xhi
     0.000000000    49.130000000 ylo yhi
     0.000000000    10.810400000 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2  15.999400
   3  28.086000
   4  28.086000

这个是data中的,那么我在in文件该怎么写呢?box和原子类型都在这儿定义了啊,求详细指导
3楼2012-12-07 21:25:24
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xinmaoqin

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-12-08 19:17:16
你试试create_atoms 1 box
         create_atoms 2 box
         create_atoms 3 box
         create_atoms 4 box 行不
4楼2012-12-08 17:14:52
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amtili

银虫 (小有名气)

嗯 好的 我明天尝试下

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2012-12-09 00:44:21
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-12 11:39:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by amtili at 2012-12-07 21:25:24
4 atom types
  
     0.000000000    49.130000000 xlo xhi
     0.000000000    49.130000000 ylo yhi
     0.000000000    10.810400000 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2  15.999400
   3  28 ...

直接用read_data读不就可以了, 在in文件里就不用再写啦。。

另外,既然是读取数据文件,就不应该再用另外create atom
6楼2012-12-11 21:07:13
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yangwenbin99

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by amtili at 2012-12-07 21:25:24
4 atom types
  
     0.000000000    49.130000000 xlo xhi
     0.000000000    49.130000000 ylo yhi
     0.000000000    10.810400000 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2  15.999400
   3  28 ...

你导出data文件时怎么是4种原子,怎么设置的,我的铁水三体摩擦导出就只有3种原子
7楼2013-04-10 10:10:06
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向东1988

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
楼主用的什么势函数啊,计算SiO2的时候?
专业
8楼2013-11-13 16:57:36
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wangfei天空

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-11 21:07:13
直接用read_data读不就可以了, 在in文件里就不用再写啦。。

另外,既然是读取数据文件,就不应该再用另外create atom...

你好  请问用石英的单晶结构   怎样建立晶体呢   请指点下 谢谢了呀
9楼2014-10-15 19:28:33
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g0701zz

新虫 (初入文坛)

怎么画的,求教!
10楼2015-05-07 21:06:53
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