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totoro1992

新虫 (初入文坛)

[求助] 普通格式的分子图怎么转成SDF,mol等格式

我想把gif png等一般格式的分子文件转化为sdf或mol或mol2,试过openbabel,但是总是“can't load”,convert0.2的话首先我不知道它能不能,其次在“运行”测试文件时它总提示“不是内部或外部命令····”
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gxdym

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-10 18:18:44
totoro1992: 金币+1, ★★★很有帮助 2013-01-09 19:00:39
clide是收费的吧,而且license还管理挺严格的,可以试一下OSRA
http://cactus.nci.nih.gov/osra/
风起的日子,我在等;雨落的时候,我在等.我以为你会心疼我风中的寂寞,你会不忍我雨中的孤单.我以为你会出现,会为我遮风挡雨.可是,望穿秋水我却望不到你的身影.
10楼2012-12-09 22:49:56
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-06 14:08:54
这个......no way。

二十多年前,曾经有公司做这个,叫做图像识别(OCR)。
现在,OCR主要是识别手写体的文字。没人再玩分子结构图的识别了。

图片,对于分子结构而言,是肉包子打狗------只去不回。
2楼2012-12-06 12:04:39
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
totoro1992: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-12-06 15:13:01
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-12-06 21:35:29
1、如果你的分子不是很复杂的话,你可以试试这个:http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/prodrg/

2、如果你自己不嫌麻烦的话,你可以试试根据你的分子式,自己画,用 hyperchem 或者 MS 等软件
3楼2012-12-06 14:11:21
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totoro1992

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-06 14:11:21
1、如果你的分子不是很复杂的话,你可以试试这个:http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/prodrg/

2、如果你自己不嫌麻烦的话,你可以试试根据你的分子式,自己画,用 hyperchem 或者 MS 等软件

嗯。自己画了。我想问下,我用chemdraw这个软件存成mol后只有一个分子能打开,其他都说“unexpected error”,这是怎么回事?谢谢
4楼2012-12-06 15:12:40
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