24小时热门版块排行榜

返回列表

本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

BioEPI: 18
应助: 599 (博士)
贵宾: 1.818
金币: 24628.2
散金: 197
红花: 48
沙发: 2
帖子: 2254
在线: 400.7小时
虫号: 1879241
注册: 2012-07-05
性别: GG
专业: 生物信息学

【答案】应助回帖

看天: BioEPI+1 2012-12-08 11:44:25

引用回帖:

3楼: Originally posted by xingdei at 2012-12-07 17:00:39
谢谢wizardfan版主的指点，按照你说的对比tutorial上的NEXUS文件，确实有差别，因为这是第一次接触这些生物信息相关知识，还是不太明白应该怎么改，你能帮我看看吗？
另外，非专业人士应该从哪儿入手学习这些生物 ...

建议就是熟练使用搜索引擎，比如google，来解决日常问题，比如你这个问题，是nexus的格式问题，那如果你搜索一下nexus file format，可以得到这个网站http://wiki.christophchamp.com/index.php/NEXUS_file_format
里面就有详细的说明，注意看
Format subcommands
The following are possible formatting subcommands:
DataType = { standard | DNA | RNA | nucleotide | protein | continuous }
RespectCase
Missing
Gap
Symbols
Equate
MatchChar
[No]Labels
Transpose
Interleave
Items
StatesFormat
[No]Tokens

在你的文件中，用了format missing=? interleave datatype=DNA gap= -;
这样的话，就很明显了，其他的都是参数=数值的格式，比如datatype(参数）=DNA（数值），而interleave这个参数没有数值，那改成interleave=true会不会有用呢？

赞一下(1人)

回复此楼

4楼2012-12-08 07:33:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

GenBank 上提交新基因的氨基酸序列一般需要多久才能录进NCBI数据库上已经有11人回复
用BankIt在线向Genbank数据库提交序列已经有265人回复
请问在GenBank上找到了一条序列，怎样知道作者所用引物的序列？已经有9人回复
求助百度上的一篇文献：如何查找基因序列？——在Genbank中寻找目的基因的实例已经有2人回复
寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申请accession number 的专家-谢谢！已经有3人回复
向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎已经有19人回复
向GENBANK提交的序列能随后修改吗？已经有5人回复
我向Genbank提交了序列并收到了登录号，可我把那封邮件弄没了，怎么再获得登录号？已经有12人回复
求教如何通过GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列已经有5人回复
【求助/交流】如何从GENBANK上查询菌株的的Acession No 已经有5人回复
【求助/交流】求关于序列上传到GENBANK的相关问题已经有5人回复
【求助/交流】有登陆号，如何批量从Genbank中导出fasta格式的核酸序列已经有6人回复
【求助/交流】求助：如何能在genbank中快速批量下载序列已经有6人回复
【求助/交流】关于序列去genbank比对的问题已经有11人回复
【求助/交流】【求助】怎样向GenBank中提交16srDNA序列已经有3人回复

点击这里搜索更多相关资源

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人

相关版块跳转我要订阅楼主 xingdei 的主题更新

返回列表