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xiaoluoerer

新虫 (初入文坛)

[求助] 求各位大神帮忙校对下DNA测序图

如图,我做菌株的鉴定,这是测序公司发过来的测序彩图,刚开始的20位有点乱,校对之后的碱基序列应该是什么样的?

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xiaoluoerer

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-12-06 08:45:25
这些位置就是不能用了,并不能凭经验就能确定是什么base的。

那就是说我要把前20位删掉再到NCBI上去比对是吗
4楼2012-12-06 12:38:57
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoluoerer: 金币+2, 有帮助 2012-12-07 09:27:32
这些位置就是不能用了,并不能凭经验就能确定是什么base的。
2楼2012-12-06 08:45:25
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
测序刚开始的地方信号是不是很好的。如果你送的是PCR产物的话就没有办法了,如果可以克隆到载体里再测序的话,可以使用载体通用引物而保证目的片段测序质量。
3楼2012-12-06 08:53:48
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoluoerer at 2012-12-06 12:38:57
那就是说我要把前20位删掉再到NCBI上去比对是吗...

难道测序公司给你的测序结果只包含峰图么?
你再看看生成的reads,已经不包含这些了的啊
5楼2012-12-06 13:18:33
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