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克隆测序结果为什么都是载体呢?
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添翼如虎
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专业: 微生物生理与生物化学
[交流]
克隆测序结果为什么都是载体呢?
已有6人参与
我回收的DNA片段扩增后条带很亮位置也对,然后做连接和转化,挑取单菌落液体培养,然后用之前扩增目标片段的引物重新扩增菌液,检测后发现也是目标片段,但是测序回来的结果在blast对比都是载体的序列?各位高手请指教
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1楼
2012-12-02 11:09:42
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m606
铜虫
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专业: 微生物生理与生物化学
★
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酶切位点 选取出问题了
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6楼
2012-12-05 11:24:26
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iaminxanadu
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性别: GG
专业: 环境微生物学
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测序后序列长度对不对啊
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2楼
2012-12-02 11:31:03
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Trista`
铜虫
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在线: 46.8小时
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注册: 2012-07-28
性别:
MM
专业: 生物信息学
★
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是不是 拿错菌了?
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结交优秀的人
3楼
2012-12-02 11:57:59
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drizzling
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在线: 77.4小时
虫号: 874573
注册: 2009-10-16
专业: 病原细菌与放线菌生物学
★ ★ ★
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laozuzunzhe: 金币+2, good
2012-12-03 10:54:10
1. 如果是PCR产物直接连接(T-载体),会存在部分空载体自身环化。
2. 单菌落液体培养前有没有经过分纯划线培养?如果没有经过反复分纯,可能是连接转化时残存的PCR产物,导致扩增阳性。根据楼主的描述产物很亮,这种可能性很大。
3.避免这种现象的方法:PCR进行筛选时,用一条你的特异引物加上一条载体上的引物(T7或SP6)搭配进行扩增。
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4楼
2012-12-02 16:10:06
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