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囧囧俏

铁虫 (小有名气)

[求助] 崩溃了 难题 跪求解答:质粒提不出,酶切切不开

PCR的目的基因1056bp连接到PMD18-T载体上,之后转入TOP10感受态细胞,酶切鉴定并测序合适后,保甘油菌种。
接下来奇怪的事情发生了:1.大概有两个星期的时间,甘油菌种转接后,试剂盒不能提出质粒:加入2液后菌液不变澄清。
                                         2.因为之前可以提出的时候还有剩余的质粒,所以将它转入TOP10感受态细胞,之后可以提出并能酶切下我的目的基因。可是过了两个月,保的菌种质粒越提越淡,现在已经提不出来了。
                                        3.由于提不出质粒,所以在2中转的平板中,有挑选了一些克隆,PCR鉴定OK,提出质粒后,酶切片段特别淡,无法胶回收。
   
我做了三个不同基因连在T载体,然后都出现了相似的问题,到底是怎么回事呢?连在PMD18-T上的基因不是很稳定吗,该载体也应该很稳定啊,为什么酶切不出基因?之前一直能提出质粒的菌种,为什么都无法提出质粒,有两个菌种能提出质粒,但是酶切后还是特别淡?
一直用的试剂盒提质粒,实验室其它人也在用没有问题,到底问题出在哪了,求神人解答!
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sxxuan

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1. 甘油的比例多少?太多了菌株反而不稳定
2. 感受态效率如何?我试过一段时间保存的菌株都失活,虫友们的建议是可能感受态活性低导致的。
3. 摇菌后菌液浓不浓?建议先鉴定一下看看是不是还是你要的那管菌,再提质粒。
4. 不管你的菌里面有没有质粒,加了P2后应该是清亮的,就算菌太多,起码也是比加P1的时候要清一些而且是粘稠的。
5. 如楼上很多虫友提过的,换一管抗生素,加100ul氨苄会导致筛选压力过大,菌长得不一定好的。
6. 切不动的话测序看看pMD18-T上的酶切位点有没有问题,我试过一次有一个项目死活切不下来,一查发现一个酶切位点突变了,特别郁闷,理论上讲T载体没有在紫外下暴露也没有做什么,就是连了个片段而已,就突变了,也不知道是原来就如此还是怎样。分子克隆很神奇的。
你的日子如何,你的力量也必如何!
18楼2012-11-28 17:03:27
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aoda123

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我之前提质粒有过提不出来的情况,我的大多原因是摇菌时间过长。在一个就是提质粒的菌液并不需要太多,一般1.5-2毫升,多了反而裂解不开。保存的菌液和质粒时间长了也可能丢失。
身体健康,工作顺利
2楼2012-11-27 11:38:59
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囧囧俏

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by aoda123 at 2012-11-27 11:38:59
我之前提质粒有过提不出来的情况,我的大多原因是摇菌时间过长。在一个就是提质粒的菌液并不需要太多,一般1.5-2毫升,多了反而裂解不开。保存的菌液和质粒时间长了也可能丢失。

谢谢 这些问题我注意到了 菌液保存的时间不长就是提不出来
3楼2012-11-27 13:30:01
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你这加了溶液2都不变清,要么是你溶液2有问题要么就是你菌用太多了~也就是说问题在你提质粒上面
顺便问一句,你保种是什么条件保存的,-20,-70还是4度?
4楼2012-11-27 14:42:37
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