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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » DNA琼脂糖凝胶电泳
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

[求助] DNA琼脂糖凝胶电泳

我提了枇杷叶的DNA ，测的OD值在2.12，是蛋白没除干净还是RNA的干扰？还有0.8%的琼脂糖凝胶电泳出现了好几条条带是什么原因呢？是双链断了吗？
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haha
1楼 2012-11-15 21:18:27
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wxlzzzz

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
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小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-11-19 13:35:57
楼主想表达的不是OD值吧，和DNA纯度有关系的是OD260/OD280和OD260/OD230这两个参数。
OD260/0D280=1.8时，理论值，DNA纯净。小于1.8有蛋白或者酚类污染，大于1.8有RNA污染。
基因组DNA长度长，提取过程中很容易断开成小段，楼主提取时候要注意这点。祝好运。
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下雨的傍晚
你做了什么，什么都没做。
2楼2012-11-15 23:48:40
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haiyanli1988

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的RNA去除干净了吗？RNA没有除干净跑胶会出现几天带很正常啊，OD值2.12，说明你的样品有RNA污染。
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下雨的傍晚
4楼2012-11-16 11:07:46
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普通回帖

hourl11

禁虫 (初入文坛)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
3楼2012-11-16 08:57:25
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wxlzzzz at 2012-11-15 23:48:40
楼主想表达的不是OD值吧，和DNA纯度有关系的是OD260/OD280和OD260/OD230这两个参数。
OD260/0D280=1.8时，理论值，DNA纯净。小于1.8有蛋白或者酚类污染，大于1.8有RNA污染。
基因组DNA长度长，提取过程中很容易断 ...

嗯，就是OD260/0D280=2.12，没有加RNA酶，因为听人家说RNA很不稳定，会很快自己降解的.是这样吗？还有提取的时候，也好小心了，可是还是断了！
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haha
5楼2012-11-16 21:36:07
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hourl11 at 2012-11-16 08:57:25
你传一张图上来看一下呗

因为只是在紫外灯下看的，所以没拍照啊！
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haha
6楼2012-11-16 21:36:51
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by haiyanli1988 at 2012-11-16 11:07:46
你的RNA去除干净了吗？RNA没有除干净跑胶会出现几天带很正常啊，OD值2.12，说明你的样品有RNA污染。

RNA没除尽会出现多条带吗？意思是DNA带RNA带吗？
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haha
7楼2012-11-16 21:38:14
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wxlzzzz

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-19 13:36:09
楼主，不能认定其他的条带就一定是断裂的DNA片段，最好做几个验证试验。加点RNA酶试一试，或者故意在提取的时候加大机械搅拌，有时候失败的实验是一种很好的参照经验啊。建议先做添加RNA酶的，因为你的OD比值的确高了，查查相关资料看看怎么用RNA酶，祝好运~
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下雨的傍晚
你做了什么，什么都没做。
8楼2012-11-17 09:38:50
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
OD值在2.12,应该是dna断裂了。
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coasttocoast。
9楼2012-11-17 10:06:10
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-19 13:36:18
DNA提取的过程是免不了有断裂出现，只是多与少的问题.DNA抽提出现多条带或者拖尾的现象都是比较正常的，RNA是比较容易降解，但是在抽提完之后立刻跑胶的话量是很大的，对电泳的影响也很大。希望对你有帮助，有其他具体问题可以直接给我写邮件。
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下雨的傍晚
10楼2012-11-17 11:52:32
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