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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » atomeye中的应变着色问题
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yandafsd

银虫 (小有名气)

[求助] atomeye中的应变着色问题

在atomeye中，有两种应变的着色方式：一是Atomistic Local von Mises Shear Strain Invariant Coloring，和Least-Square Atomic Local Strain Tensor Coloring。我用lammps输出的cfg格式文件，想用后边的应变着色方案进行着色，看手册上的操作方法是打开一帧图片（某一步的），然后按ESC，则这步被系统作为参照系，后边打开的任何一附图都以此为标准计算应变，将计算结果写到cfg文件里边，然后又Alt+数字键着色。但是我按照上边的方法操作时，虽然标题上显示的是eta_ Mises应变，但所有的图都是一种颜色（深蓝），根本看不到局域应变啊，atomeye带的软件包annotate_atomic_strain.i686效果和上面一样，请问怎么解决？？
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1楼 2012-11-04 09:36:51
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韩欢欢

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yandafsd at 2012-11-05 09:54:05
先谢谢你，您说的那个是应力吧，是不是用dump记录xx,yy,zz,xy,xz,yz六个方向的应力，输出到cfg文件中，用atomeye看，用alt+0,1...9分别着色，而应变是整体变量，不是原子类别上的，不能用dump输出，所以想用annota ...

你好，请问下，你的Extended CFG 格式的文件是怎么得到的？我用lmp2cfg得到的是标准的cfg格式，不能做应变的着色，请问你是怎么转换成所需的格式的。lammps新手请教
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Demi
4楼2013-09-03 21:44:00
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phq323

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-05 08:31:31
请仔细阅读手册，上面有介绍。
以前用过，好像是按alt+0, 1, 2等可以调色。这要在输入文件中设置的。
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顶帖也是一种收获！
2楼2012-11-04 22:41:04
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yandafsd

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by phq323 at 2012-11-04 22:41:04
请仔细阅读手册，上面有介绍。
以前用过，好像是按alt+0, 1, 2等可以调色。这要在输入文件中设置的。

先谢谢你，您说的那个是应力吧，是不是用dump记录xx,yy,zz,xy,xz,yz六个方向的应力，输出到cfg文件中，用atomeye看，用alt+0,1...9分别着色，而应变是整体变量，不是原子类别上的，不能用dump输出，所以想用annotate_atomic_strain.i686看，但结果不理想
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3楼2012-11-05 09:54:05
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yandafsd

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 韩欢欢 at 2013-09-03 21:44:00
你好，请问下，你的Extended CFG 格式的文件是怎么得到的？我用lmp2cfg得到的是标准的cfg格式，不能做应变的着色，请问你是怎么转换成所需的格式的。lammps新手请教...

lammps可以直接输出
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5楼2013-12-13 11:23:01
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