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wwb168

银虫 (小有名气)

[求助] 同源模型的建立

本人是初学者,由于老板要求做MTOR抑制剂同源模型的建立,本人无从下手,跪求高手帮忙!
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songyunlong

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-12-13 14:29:43
使用http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 提供的在线结构预测服务器。

I-TASSER server is an on-line platform for protein structure and function predictions. 3D models are built based on multiple-threading alignments by LOMETS and iterative TASSER assembly simulations; function inslights are then derived by matching the predicted models with BioLiP protein function database. I-TASSER (as 'Zhang-Server') was ranked as the No 1 server for protein structure prediction in recent CASP7, CASP8 and CASP9 experiments.

这个大概是目前最好的同源蛋白模建软件了,可是连续三次在CASP的评比中获得第一的哦。
为了人类美好的明天!!
7楼2012-12-09 17:45:35
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messi1910

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-03 16:29:20
蛋白质的同源建模吗?可以用swiss-model在线的服务
2楼2012-11-01 16:58:41
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liuwei4410

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-03 16:29:26
modeller也可以,我用的modeller!
一切都是浮云,开心最重要!
3楼2012-11-03 16:18:08
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-30 09:25:32
1.上网查阅同源模建的基本概念与适用范围,初步明确自己的体系是否可以用同源模建构建三维结构。
2.选择合适的同源模建软件,如在线的swiss-model和可本地安装的modeller,对其使用和结果分析有初步的了解,进一步的优化蛋白结构。
4楼2012-11-03 19:42:41
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