应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 关于建模的一点问题，求解答
51/1返回列表
查看: 1551  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

青青97

银虫 (小有名气)

[求助] 关于建模的一点问题，求解答

建模的时候出现Chosen position is within the specified tolerance(1.0) of existing atoms.看以前的帖子说是原子占据了，但这个怎么解决啊，我是从无机数据库下的数据，最主要的是让别人重建了一下他就没出现这个问题，但又看不出哪有什么不同来，各位大神求解答啊，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-30 22:58:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

digghost

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-11-03 13:26:34
引用回帖:
6楼: Originally posted by 青青97 at 2012-11-02 08:45:19
通过ICSD上的txt建模它不会告诉你晶格间距的啊？...

找到相邻原子的坐标，然后求距离，看是不是小于1A
赞一下 回复此楼
呵呵了
7楼2012-11-02 23:46:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-11-01 15:27:12
有时候直接从ICSD中导出的cif文件  直接导入到MS汇总 会出现原子重叠问题。这个感觉是ms识别不太好。
解决方法：你可以把ICSD中导出的cif文件，用另外以一种软件打开  转换一下格式 然后在导入到ms。
赞一下 回复此楼
从明天开始坚持吃早饭呀！
2楼2012-10-31 15:00:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青青97

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wzbhit at 2012-10-31 15:00:50
有时候直接从ICSD中导出的cif文件  直接导入到MS汇总 会出现原子重叠问题。这个感觉是ms识别不太好。
解决方法：你可以把ICSD中导出的cif文件，用另外以一种软件打开  转换一下格式 然后在导入到ms。

谢谢，我是根据txt文件建的，出现问题是因为什么啊？
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-31 22:02:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-11-01 15:27:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青青97 at 2012-10-31 22:02:12
谢谢，我是根据txt文件建的，出现问题是因为什么啊？...

可能会在一个site有partial occupancy
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-01 09:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 01:14 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 01:14 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 01:12 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 01:04 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 00:53 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-29 22:27 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:44 by 4qO8zhfjr2AX
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:33 by 4qO8zhfjr2AX
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 面上意见出来了 +8 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 16/800 2026-08-29 20:45 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭