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wendy76

银虫 (小有名气)

[求助] 一段序列(不是基因,是非编码RNA)怎么知道都有哪些miRNA可能作用于他呢?

如题,有一段长链非编码RNA,用什么方法知道有哪些miRNA可能作用于他呢?targetscan中只能输入基因名称啊,这种非基因序列如何分析能,请大家指教!
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我来了
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微笑lili

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


wendy76: 金币+1, 有帮助, 是基因间序列。。。。。不过另一位网友帮我找到解决办法了!谢谢! 2012-11-05 11:03:49
我也不清楚,但是我想能不能试试将这段非编码RNA比对后找到其所在的基因,然后在targetscan中输入这个基因的名字,再找相应的miRNA,不知道这样行不行。
2楼2012-11-05 00:20:43
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竹子小小

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

3楼2012-11-05 09:12:26
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wendy76

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 竹子小小 at 2012-11-05 09:12:26
用http://www.mirbase.org/search.shtml就可以了啊,

多谢!
我来了
4楼2012-11-05 11:06:06
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baby1987

金虫 (小有名气)

与小RNA库做blast,应该可以。
加油。
5楼2013-04-07 22:00:44
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