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dafeizizhu

铜虫 (小有名气)


[交流] 在PCR仪中,从95度均匀降温到25度,怎么弄才能90s降温1度?

最近,我要自己合成接头,接头的序列都知道,也从公司合成了单链,现在要把接头的两条单链通过退火来合成双链的。从网上看到碧云天的退火buffer,都说挺好使的,就买了。仔细阅读说明书后,才发现,里面有一个均匀退火的步骤,不好弄。是这样说的,每8s降温0.1度,如果PCR仪不具备这种功能的话,也可以90s降温1度。我从我们使用的PCR仪(ABI 2720)上,怎么弄都弄不好。从别的实验室找PCR仪,找到的能设置降温速度的,但是他们那里设置的*.*℃/s,看这格式,最慢的速度是0,1度每秒,而我要求的是0.01度每秒。又打算使用多不保温步骤来设置,90s降温1度,需要70步,但是PCR仪上最多六个HOLD 步骤。崩溃。。。。。。。
求助各位大仙们,有什么好的办法吗?
注:我从网上看到把水烧开,放到室内,把要退火的体系放进去,让开水自然冷却,之后就能使用。这个方法很不错的。但是我们老师听到这个方法后就直接给我回绝了。想想,开水自然冷却,开始的时候降温快,随后降温速度慢,整体降温不均匀,可能会影响实验。但是 ,在退火过程中,降温的快慢又有什么影响呢?在普通PCR过程中,退火时的降温速率很快的,引物同样能结合到模板上,而均匀降温又是何解?大仙们,给个答案吧!please!
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494750284

木虫 (小有名气)



dafeizizhu(金币+1): 谢谢参与
问过试剂盒的技术人员了吗,可能没有那么严格的要求,如果有的话看看他们是如何实现的。

[ Last edited by 494750284 on 2012-10-25 at 12:20 ]
2楼2012-10-25 12:07:32
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wjswj

木虫 (正式写手)



dafeizizhu(金币+1): 谢谢参与
还是咨询技服人员吧,个人认为没必要那么严格。
3楼2012-10-25 14:44:26
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huxx

金虫 (小有名气)



dafeizizhu(金币+1): 谢谢参与
不需要那么严谨.  引物溶解后, 混一下, 加入PCR BUFFER. 至1X.     90s 冷却下来还是10min冷却下来都可以.    开水缓慢降温也可以.  水多冷却慢, 水少冷却快. 看着办.  那么短很容易结合的.
16楼2012-10-25 15:56:02
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匿名

用户注销 (正式写手)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-26 13:38:55
本帖仅楼主可见
22楼2012-10-25 18:06:12
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分子菜鸟

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用touch down的程序改改是不是可以
23楼2012-10-26 10:18:21
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aloon111

金虫 (正式写手)


有点难度
24楼2012-10-26 10:33:37
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尚慕寒

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
把水烧开,放到室内,把要退火的体系放进去,让开水自然冷却,之后就能使用。
这个方法是可以用的,类似实验我做过很多次了,把装开水的烧杯放到可以保温的环境(比如泡沫盒或关闭电源的培养箱),效果更好。
祝好
25楼2012-10-27 20:00:21
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尚慕寒

铜虫 (初入文坛)


另外特别要小心EP管不要漏水,最好用封口膜缠上
26楼2012-10-27 20:01:21
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沐风512

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用touchdown这个程序,每个循环降1度,共70循环,每个循环90s。△T为-1度
27楼2018-09-26 15:11:20
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简单回复
2012-10-25 14:48   回复  
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fuhanmei5楼
2012-10-25 15:03   回复  
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wasxnbe6楼
2012-10-25 15:09   回复  
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liushuyan7楼
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liufudong8楼
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yahoo345110楼
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lanse784111楼
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wuyun12312楼
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liang888714楼
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woai82017楼
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太阳345218楼
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chenghu20楼
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but水货21楼
2012-10-25 16:14   回复  
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