应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » data文件的问题
51/1返回列表
查看: 1365  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xinmaoqin

银虫 (小有名气)

[求助] data文件的问题

我用MS建模之后导出，再用msi2lmp工具转化为data文件，但是得到的文件里边只有原子的数目及类型，键、健角的类型、数目，没有各原子的坐标信息，求高手指导啊~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-23 21:41:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xinmaoqin

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-12 14:20:46
具体说明一下， Ms 导出的car文件有原子坐标， 把你的文件贴出来看看

这个问题已经解决了，没用那个工具转化，MS输出之后就直接按照data文件要求格式修改了
赞一下 回复此楼
3楼2012-12-12 18:33:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-12-12 14:24:44
具体说明一下， Ms 导出的car文件有原子坐标， 把你的文件贴出来看看
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-12 14:20:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

向东1988

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xinmaoqin at 2012-12-12 18:33:56
这个问题已经解决了，没用那个工具转化，MS输出之后就直接按照data文件要求格式修改了...

请问下楼主，MS输出成什么格式的啊？是.pdb吗？后续怎么改啊
赞一下 回复此楼
专业
4楼2013-10-31 20:17:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天道and酬勤

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-11-01 08:35:11
引用回帖:
4楼: Originally posted by 向东1988 at 2013-10-31 20:17:46
请问下楼主，MS输出成什么格式的啊？是.pdb吗？后续怎么改啊...

按照lammps手册上的atom style修改，比如in文件中atom style 是atomic，就有特定的data格式。你用MS导出的话导出car格式可以的，导出之前赋予cvff力场，再用工具转化。
赞一下 回复此楼
游走在学术海洋的小鱼
5楼2013-10-31 22:42:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭