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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps里的随机种子是如何确定的？
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ldj168168

金虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 剑雪封侯 at 2013-05-15 18:45:41
你的data文件的格式不对 每一种atom-style对应一种文件格式，你看看read-data部分。...

我做的是石墨烯传热的，atom_style是atomic，只有一种原子，read_data文件部分看过了没有看出是什么问题。
LAMMPS 2005 data file for 6801
   1920 atoms
   1 atom types

     0.000000000    25.565100000 xlo xhi
     0.000000000   196.799900000 ylo yhi
     0.000000000     6.800000000 zlo zhi

Masses

   1  12.011150

Atoms


1        1        0.710140519        1.22999946        3.4
2        1        2.840562078        0        3.4
3        1        1.420281039        0        3.4
4        1        3.550702597        1.22999946        3.4
5        1        4.970983636        1.22999946        3.4
6        1        7.101405194        0        3.4
7        1        5.681124156        0        3.4
8        1        7.811545714        1.22999946        3.4
9        1        9.231826753        1.22999946        3.4
10        1        11.36224831        0        3.4
11        1        9.941967272        0        3.4
12        1        12.07238883        1.22999946        3.4
13        1        13.49266987        1.22999946        3.4
14        1        15.62309143        0        3.4
15        1        14.20281039        0        3.4
16        1        16.33323195        1.22999946        3.4
17        1        17.75351299        1.22999946        3.4
18        1        19.88393454        0        3.4
19        1        18.46365351        0        3.4
20        1        20.59407506        1.22999946        3.4
21        1        22.0143561        1.22999946        3.4
22        1        24.14477766        0        3.4
23        1        22.72449662        0        3.4
24        1        24.85491818        1.22999946        3.4
25        1        0.710140519        3.689998381        3.4
26        1        2.840562078        2.45999892        3.4
27        1        1.420281039        2.45999892        3.4
28        1        3.550702597        3.689998381        3.4
29        1        4.970983636        3.689998381        3.4
30        1        7.101405194        2.45999892        3.4
31        1        5.681124156        2.45999892        3.4
32        1        7.811545714        3.689998381        3.4
33        1        9.231826753        3.689998381        3.4
34        1        11.36224831        2.45999892        3.4
35        1        9.941967272        2.45999892        3.4
36        1        12.07238883        3.689998381        3.4
37        1        13.49266987        3.689998381        3.4
38        1        15.62309143        2.45999892        3.4
39        1        14.20281039        2.45999892        3.4
40        1        16.33323195        3.689998381        3.4
41        1        17.75351299        3.689998381        3.4
42        1        19.88393454        2.45999892        3.4
43        1        18.46365351        2.45999892        3.4
44        1        20.59407506        3.689998381        3.4
45        1        22.0143561        3.689998381        3.4
46        1        24.14477766        2.45999892        3.4
47        1        22.72449662        2.45999892        3.4
48        1        24.85491818        3.689998381        3.4
49        1        0.710140519        6.149997301        3.4
50        1        2.840562078        4.919997841        3.4
51        1        1.420281039        4.919997841        3.4
52        1        3.550702597        6.149997301        3.4
53        1        4.970983636        6.149997301        3.4
54        1        7.101405194        4.919997841        3.4
55        1        5.681124156        4.919997841        3.4
56        1        7.811545714        6.149997301        3.4
57        1        9.231826753        6.149997301        3.4
58        1        11.36224831        4.919997841        3.4
59        1        9.941967272        4.919997841        3.4
60        1        12.07238883        6.149997301        3.4
61        1        13.49266987        6.149997301        3.4
62        1        15.62309143        4.919997841        3.4
63        1        14.20281039        4.919997841        3.4
64        1        16.33323195        6.149997301        3.4
65        1        17.75351299        6.149997301        3.4
66        1        19.88393454        4.919997841        3.4
67        1        18.46365351        4.919997841        3.4
68        1        20.59407506        6.149997301        3.4
69        1        22.0143561        6.149997301        3.4
70        1        24.14477766        4.919997841        3.4
71        1        22.72449662        4.919997841        3.4
72        1        24.85491818        6.149997301        3.4
73        1        0.710140519        8.609996221        3.4
这是前面部分文件，您帮看下？
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11楼2013-05-15 21:51:02
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lixiaojun305

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by ldj168168 at 2013-05-15 15:49:03
弱弱的问下，您是怎么修改的啊？我的情况出现和你差不多。ERROR：Incorrect atom format in data file（atom.cpp:768) .请问这是说明第768个原子有问题吗？（atom.cpp:768)...

应该是与cpp中第768行不符合
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12楼2013-06-25 15:46:25
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奈落之夜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by ldj168168 at 2013-05-15 21:51:02
我做的是石墨烯传热的，atom_style是atomic，只有一种原子，read_data文件部分看过了没有看出是什么问题。
LAMMPS 2005 data file for 6801
   1920 atoms
   1 atom types

     0.000000000    25.56510000 ...

请问你解决这个问题了吗?
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13楼2014-02-23 14:32:54
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