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ysn5048

银虫 (小有名气)

[求助] 双酶切没有切开,怎么回事啊

本人最近想把目的片段连接在表达载体pET15b上,我的两条目的片段均约1000bp,下图为酶切回收前的鉴定图,左边15000的Marker,右边2000的Marker,15000Marker右边第一条带是pET15b质粒酶切的结果,第二条是T载体连目的片段的酶切结果,第三条什么也没有,第四条同样是pET15b质粒酶切的结果,第五条是T载体连另一目的片段的结果。

ysn20121015pet15b,T-t①,T-h⒄双酶切.jpg
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ysn5048: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-15 22:25:01
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-16 13:47:36
建议你酶切前对质粒进行定量(可以直接用OD260或电泳分析的方法,详见分子克隆),然后根据你实验的需要,取适当的量进行酶切分析,一般来说:简单的酶切鉴定,酶切500ng-1ug的质粒DNA就足够了,如果需要回收载体大片段用于随后的基因克隆,则需要1-2ug的质粒DNA,如果回收小片段进行亚克隆,则需要2-4ug的质粒DNA.
更重要的是,为了确保质粒酶切完全或者避免出现酶的星活性,建议利用免费的double digestion designer软件进行双酶切的实验设计,可以确保质粒的完全酶切,或者避免因加的酶量太多而导致质粒DNA出现smear现象。祝一切顺利。
5楼2012-10-15 21:21:41
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查看全部 7 个回答

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议你把pET15b质粒也跑个电泳看一下,是不是质粒的问题!
持之以恒、永不放弃!
2楼2012-10-15 18:09:38
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ysn5048

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-10-15 18:09:38
建议你把pET15b质粒也跑个电泳看一下,是不是质粒的问题!

这是我在酶切之前跑的质粒图,同样是15k的marker右边第一条是pET15b,另外两个是两条目的片段连接T载体的质粒

ysn20121015提取质粒pet15b,T-t①,T-h⒄.jpg

有时候,一句话,可以改变未来
3楼2012-10-15 18:35:29
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水寒冰006

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉你要酶切的东西都已经降解了,体系用的水是不是有污染,但是一般来说质粒还是蛮稳定的,还有就是用的两个酶的buffer是不是共有的可以看一下。
4楼2012-10-15 21:14:00
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