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sengseng2011

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序结果中出现一个Gap怎么办 已有3人参与

我构建了一个质粒,送菌液出去测序,结果出现了一个gap,其他序列比对都过了,这是测序的问题还是我质粒的问题?各位高手说说我该怎么办?这个Gap会影响表达吗?

360截图20121013103624281.jpg
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sengseng2011

新虫 (初入文坛)

我在做pcr时用的是普通的Tag酶,目的基因870bp,是不是没用高保真酶的原因?但是我听人家说1000bp以内的Tag酶问题不大的啊,极度不甘心中,要么我再拿这个样品去别的公司测测。
4楼2012-10-13 23:42:39
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查看全部 7 个回答

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
分析一下gap位置测序的峰图,有可能是读序错误。如果真的有gap,表达的产物会发生移码,必须重新做克隆。
2楼2012-10-13 15:32:25
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sengseng2011

新虫 (初入文坛)

好像读序没有错啊,郁闷了
3楼2012-10-13 22:23:01
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chenzhu198

铁杆木虫 (著名写手)

版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by sengseng2011 at 2012-10-13 23:42:39
我在做pcr时用的是普通的Tag酶,目的基因870bp,是不是没用高保真酶的原因?但是我听人家说1000bp以内的Tag酶问题不大的啊,极度不甘心中,要么我再拿这个样品去别的公司测测。

这个最好是用高保真的酶.....
红砖并进,理实交融!
5楼2012-10-14 22:40:47
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