| 查看: 2286 | 回复: 16 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
大家帮看看我做这个系统发育树是否可用，做法是否正确，谢谢了~~
|
|||
|
本人小硕一枚，分子生物学这方面完全就是菜鸟的级别。现在面临菌种的鉴定，已经给上海生工做了16s rDNA，得到了菌株的序列，也列出了DNA序列与之相近的几种菌。后面的做法是不是跟踪NCBI网站上所列出的菌的详细消息，复制ORIGIN后面的序列，做出TXT文档？我把我的未知菌的序列同样做了TXT文档，并且每个菌的序列单独做个文档，这样是正确的吧？后面是依照好心的虫友们提供的办法，用MEGA5.0建了发育树，现在就不知道这个发育树建得正不正确，该怎样分析？ PS:是不是那个99后的菌就是和我的菌最相同的啊？ |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 菌种确定分析.doc
2012-10-11 20:17:06, 27.5 K
» 猜你喜欢
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有10人回复
-
现代”学阀”该如何界定
已经有9人回复
-
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
-
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组-博士研究生
已经有10人回复
-
申博发邮件
已经有11人回复
-
各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？
已经有12人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
|
谢谢你~你说的是这个网页吧http://ezgenome.ezbiocloud.net/，我进去了，但模式菌株的相似度最大也就95%这样，而且为什么根据模式菌株的NCBI登录号，得不到16s rDNA的序列呢？单单用NCBI比对的都能找得到。。。  图1是我在模式菌种的部分搜索结果，第一个NCBI的登录号是PRJNA54613，在NCBI PLAST后，得的结果如图2。。。图3是模式菌种比对结果中第一个的详细资料，请大家指点，我是不是哪里弄错了了~   1.jpg  2.jpg  3.jpg |
11楼2012-10-18 16:19:18
2楼2012-10-13 18:29:23
allencindy
铁虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 210.3
- 红花: 1
- 帖子: 56
- 在线: 34.1小时
- 虫号: 725506
- 注册: 2009-03-18
- 专业: 环境微生物学
3楼2012-10-14 00:31:57
allencindy
铁虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 210.3
- 红花: 1
- 帖子: 56
- 在线: 34.1小时
- 虫号: 725506
- 注册: 2009-03-18
- 专业: 环境微生物学
4楼2012-10-14 00:34:33