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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质等电点计算 题目解答
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质等电点计算 题目解答

1、 求二肽Lys-Lys和三肽Lys-Lys-Lys的等电点。已知Lys的α-氨基的 pKa 2.18，pkb 8.95,pkε 10.53

2、计算Lys-Ala-Glu-Gly-Lys-Lys的等电点。已知Lys的α-氨基的pKa为8.95，ε -氨基的pKa为10.53，Glu的α-羧基的pKa为2.19，γ-羧基的pKa为4.25。

3、有一个蛋白质拥有30个侧链羧基（pKa 4.3），10个咪唑基团（pKa 7.0），15个 ε-氨基（pKa 10.0）。求该蛋白质的等电点。  

复旦真题，一直早不到答案，求大神指教
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1楼2012-10-08 16:15:38
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 龙儿无双 at 2012-10-09 08:06:55
解释一下怎么算的啊，光给个答案有啥用

对呀对呀~求算法
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5楼2012-10-09 14:16:20
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
wizardfan: 金币+3, BioEPI+1, 感谢非常详细的回答 2012-10-13 03:48:29
1 Handerson-Hasselbalch公式中的pka可以对应的是任一PH条件下的当前解离基团pk值，当等电点时，ph=pi=pka+lg[质子受体]/[质子供体]，而PI与兼性离子两侧的PK值有关，而兼性离子出现在最后一步解离之间，建议你写出具体的解离简式R+++，R+++-，R++-，R-，明白了吗，就是第三个和第四个之间，三个lys同上分析，希望你好运。2肽链在0-14不解离，见王镜岩上册第三版164页倒数第三行最后几句话，只有两侧游离的碳末端和氮末端参与解离，其余的以肽键予以“中和”，祝你好运。3你写出解离简式就明白那个是供体那个是受体，比如咪唑基，即可以作为供体也可以作为受体。相见上册134页下面lys和glu解离过程图，我对学生的要求是要快速写出解离简式，祝你好运
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18楼2012-10-12 21:15:34
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
21楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-16 15:24:46
全部的解离过程为R2+，R+，R0，R-，R2-。对应的PK依次为2.19,4.25,8.95,10.53，现在明白了吗，取兼性离子两侧PK算术平均值，对于前面那个题是最后一步为兼性离子，对于本题是第二步解离呀，正确答案为（4.25+8.95） ...

是第二步和第三步之间呀，前面打错了
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23楼2012-10-16 15:49:32
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
蓝染1046: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2012-10-11 18:05:21
第一个中前一个答案为10.53，后一个为10.53+lg2；其余的比较简单一些
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2楼2012-10-08 17:33:40
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
第一个后者为10.83
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3楼2012-10-08 17:56:08
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龙儿无双

金虫 (著名写手)
解释一下怎么算的啊，光给个答案有啥用
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4楼2012-10-09 08:06:55
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-08 17:33:40
第一个中前一个答案为10.53，后一个为10.53+lg2；其余的比较简单一些

怎么算的呀
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6楼2012-10-09 14:16:47
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-09 14:16:47
怎么算的呀...

我忙完了给你发过来
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7楼2012-10-10 21:46:42
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 龙儿无双 at 2012-10-09 08:06:55
解释一下怎么算的啊，光给个答案有啥用

我忙完了一天之内给你发过来
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8楼2012-10-10 21:46:59
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

lys二肽计算：由于没有明显的无兼性离子，所以可将R++-变为R+/2 +/2 -，及相当于50%解离，则PI=PKa=10.53；后者同样处理 将R+++-变为R+/3 +/3 +/3 -,计算ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83
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9楼2012-10-10 21:52:14
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-09 14:16:20
对呀对呀~求算法
...

lys二肽计算：由于没有明显的无兼性离子，所以可将R++-变为R+/2 +/2 -，及相当于50%解离，则PI=PKa=10.53；后者同样处理 将R+++-变为R+/3 +/3 +/3 -,计算ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83
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10楼2012-10-10 21:52:33
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