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zxd95

至尊木虫 (著名写手)

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专业: 无机非金属材料

[交流] 植物转录组测序已有14人参与

最近设计实验，想弄清龙胆苷类代谢途径，首先想到了转录组测序，找代谢相关基因。龙胆的基因组还没有测序，测序后是无参照的。进行转录组测序有什么要求，需要注意哪些问题？可以选用拟南芥做参照进行功能注释吗？希望做过转录组的同志们指点指点，谢谢！

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追梦的人

1楼 2012-10-05 11:07:57

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zxd95

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引用回帖:

5楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-11-23 08:56:11
先暂时把怎么分析这个问题放到一边，先请教一下这个实验打算怎么设计呢？
目的已经明确了：龙胆（物种）苷类代谢途径（对象）
那么：你手头是有这个苷类代谢的异常表型（突变）株么？还是通过某种刺激可以实现 ...

对照：龙胆的叶片；
实验组：龙胆的根
苷类代谢在根中合成和累积，在叶中则很少或没有