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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 进化树
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

[求助] 进化树

要画进化树，有两个问题请教：
1.在NCBI上下载了一些序列，请问如何快速判断这些序列的正反向？
2.用Clustal X比对后，不同长度的序列需要进行裁剪吗？如果需要，应该怎么操作？
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1楼 2012-10-02 13:34:43
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chenguestc at 2012-10-02 22:38:36
你下载的序列都是5‘到3’方向的哈...

就是说，NCBI上的序列基本都是5’-3’的？那我如果要上传序列，也要把我的序列都设成5‘-3’的再上传吗？
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7楼2012-10-03 10:25:17
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-02 17:01:01
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-02 21:38:43
1,把所有序列设成同一方向即可。
2，需要删除多余部分。把多余部分在MEGA中选中，DELET即可。
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2楼2012-10-02 14:30:15
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-10-02 14:30:15
1,把所有序列设成同一方向即可。
2，需要删除多余部分。把多余部分在MEGA中选中，DELET即可。

非常感谢！可是“把所有序列设成同一方向”是什么意思？
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3楼2012-10-02 17:01:58
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qiuqu_200212

至尊木虫 (知名作家)

无助又无奈

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+1 2012-10-03 10:23:10
如果长短差异太大，建议剪切一下，然后用不同的软件采用不同的方法构建。
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无奈又无助的天鹅，孤零零
4楼2012-10-02 20:05:25
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