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cxb-abc

银虫 (小有名气)

[交流] 挑单克隆后,菌液PCR检测所有条带都偏小,目的条带没有出现 已有7人参与

各位高手大家好,我最近做转化,Page胶回收片段在400bp左右,挑单克隆后PCR菌液目的条带没有出现,但在250bp左右出现一条带,不知何故?以下是我做的7个样,每个样挑3个单菌克隆,PCR产物图片如下:

2012-9-22-11-08-37.jpg
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chenguestc

木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-09-28 14:47:07
个人觉得,你老板说的可能性很小。
建议从切胶重新做。
1,切胶回收后请取几微升跑胶确定分子量是对的
2,分子量对再连接转化再涂平板
3,菌落PCR检测,用你的特异引物和通用引物一起来检测
5楼2012-09-28 12:20:43
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无疆@行者

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
LZ可以拿出一两个,提取质粒,做一下酶切鉴定,如果酶切正常那么说明是对的,酶切不正常那肯定不对,不过一般来说PCR条带不对,阳性克隆的可能性很小
2楼2012-09-27 23:47:32
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Frank王

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可能没连接上,最好挑几个测序看看。
3楼2012-09-28 09:53:32
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cxb-abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 无疆@行者 at 2012-09-27 23:47:32
LZ可以拿出一两个,提取质粒,做一下酶切鉴定,如果酶切正常那么说明是对的,酶切不正常那肯定不对,不过一般来说PCR条带不对,阳性克隆的可能性很小

谢谢,我得PAGE胶放了有2个月了,老师说可能胶板上的微生物作用是原始DNA差异片段降解了,目前还没有跑出新版,待解决中
4楼2012-09-28 11:21:58
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