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PA键对分析软件
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| 我想利用对分析方法，是不是得借助PA键对分析软件啊？还有这个软件是免费的吗？在哪里可以下到？有源代码更好，可以在Linux下编译运行 |
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【答案】应助回帖
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chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-09-29 10:35:07
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-09-29 10:35:07
| 我觉得是没问题的呀！这个跟你的系统、你的服务器关系不大的！如果一定要从编译的角度考虑的话，我倒觉得跟你的编译器可能有一点关系。但这统统都是次要的！关键是算法！先从cor文件中读入数据，然后进行分析和统计，最后输出统计结果。写完代码后，写一个makefile文件，然后放到服务器上去编译就行了啊。服务器上编译通过的话，应该不会有不兼容的问题的。算法也不难设计，最笨的办法就是把确定一个原子，然后计算体系和镜像中所有的原子跟它的距离，如果小于第一近邻，则认为是近邻原子。有了近邻原子后，还有什么不会算的呢？要巧的话，就没有底了。 |
6楼2012-09-28 20:53:05
2楼2012-09-25 19:44:05
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是Pair Analysis, 具体要这种：分析中用原子对(Atomic Pair)识别一对原子之间的成键关系，即他们和周围共有的近邻原子之间的成键关系，以及这些共有的近邻原子之间的成键关系。这里所谓成键是指两个原子之间距离小于或等于由g(r) 第一谷确定的最近临距离。Honecutt Andersen用4个指数 ijlm 来标识各种类型的原子对：i =1表示任意原子对AB成键，i=2表示不成；j 表示A、B原子周围同时与A、B成键的原子数目；l 表示与A、B成键的j个原子之间成键的数目；由于I、j、l不能唯一确定某些原子集团、所以要加上另外一个参数m来标识l 所反映的成键方式。 我需要分析的粒子数少则几万，多则几十万，可以分析吗？还有怎么编？有教程吗？谢谢您了 |
3楼2012-09-27 16:17:32
4楼2012-09-27 18:32:15
5楼2012-09-28 18:40:26
7楼2012-09-29 10:14:21
8楼2012-09-30 14:23:34
9楼2012-09-30 16:23:13
10楼2012-10-01 16:24:16
