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wenxianliu

金虫 (小有名气)

[求助] 用SMD计算溶剂化效应

本人想用SMD模型计算溶剂化效应,输入文件加关键词                    # B3LYP/genecp SCF=Tight SCRF=(SMD,read,Solvent=dichloromethane),这样有问题吗?
计算正常结束,一般取哪个值呢?

SCF Done:  E(RB3LYP) =  -622.415964409     A.U. after   18 cycles
             Convg  =    0.6516D-08             -V/T =  2.1925
SMD-CDS (non-electrostatic) energy       (kcal/mol) =      -4.18
(included in total energy above)
上面的数据是从输出文件中复制的。
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-09-22 17:05:57
取-622.415964409。这个值已经包含了溶剂对总能量产生的极性和非极性贡献

PCM计算结果你取的那个值呢
SCF Done:  E(RB+HF-LYP) =  -622.394062642     A.U. after   12 cycles
             Convg  =    0.2766D-08             -V/T =  2.1925
             S**2   =   0.0000
--------------------------------------------------------------------
Variational PCM results
=======================
                     (a.u.) =    -622.385519
                     (a.u.) =    -622.392928
                     (a.u.) =    -622.394058
                     (a.u.) =    -622.384165
                     (a.u.) =    -622.394063
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =    -622.387108
--------------------------------------------------------------------
(Unpolarized solute)-Solvent             (kcal/mol) =      -4.65
(Polarized solute)-Solvent               (kcal/mol) =      -6.21
Solute polarization                      (kcal/mol) =       0.85
Total electrostatic                      (kcal/mol) =      -5.36
--------------------------------------------------------------------
Cavitation energy                        (kcal/mol) =      26.60
Dispersion energy                        (kcal/mol) =     -25.36
Repulsion energy                         (kcal/mol) =       3.13
Total non electrostatic                  (kcal/mol) =       4.36
DeltaG (solv)                            (kcal/mol) =      -1.00
--------------------------------------------------------------------
Dipole moment (Debye):
in vacuo    : X= -0.3732 Y= -5.8156 Z=  5.0735 Tot=  7.7266
in solution : X= -0.6303 Y= -7.2138 Z=  5.9762 Tot=  9.3889
--------------------------------------------------------------------
6楼2012-09-23 16:54:31
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查看全部 10 个回答

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wenxianliu: 金币+2, 有帮助 2012-09-23 16:42:35
gmy1990: 金币+2 2012-09-23 17:00:44
取-622.415964409。这个值已经包含了溶剂对总能量产生的极性和非极性贡献
2楼2012-09-22 17:05:57
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
SMD书与溶剂化能中非静电作用那一块
3楼2012-09-22 18:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wenxianliu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-09-22 18:42:50
SMD书与溶剂化能中非静电作用那一块

什么意思呀
4楼2012-09-23 16:42:02
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