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liu108

木虫 (正式写手)

[求助] VASP计算neb的步骤

给位同仁:
       本人正在学习vasp中NEB的计算,vasp为4.6版本,执行程序为vasp-vt。因为是新手,所以在计算步骤上还不是太了解,还望给位高手指点。我首先是做好了初态和终态,并用脚本nebmake.pl产生了5个构象,5个构象和两个初态终态的POSCAR被自动保存到了7个子文件夹中。接下来我在总目录下设置了INCAR, KPOINTS,POTCAR,运行vasp-vt进行计算。现在计算完了,但是接下来该怎么做呢?还有就是我之前所做的各个步骤有没有错呢?还请给位高手指点。
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会当凌绝顶,一览众山小。
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liu108

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么?不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗?最多再画个reaction path,不知道你还想干嘛

NEB怎么来判断反应呢?我的反应物和生成物的结构怎么做呢?
会当凌绝顶,一览众山小。
4楼2012-09-19 17:24:39
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-09-20 16:59:14
你做NEB的目的是什么?不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗?最多再画个reaction path,不知道你还想干嘛
2楼2012-09-19 16:34:18
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liu108

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么?不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗?最多再画个reaction path,不知道你还想干嘛

嗯,是的,就是计算过渡态的,但是具体的步骤不是很清晰,不知道做的对不对,还望指点。
会当凌绝顶,一览众山小。
3楼2012-09-19 16:52:34
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-20 16:59:35
liu108: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-09-21 08:51:14
liu108: 金币+10 2012-10-05 10:19:42
引用回帖:
4楼: Originally posted by liu108 at 2012-09-19 17:24:39
NEB怎么来判断反应呢?我的反应物和生成物的结构怎么做呢?...

根据活化能判断反应难易
测试反应物可能的吸附结构,最稳定者做初态;根据反应物猜测可能的生成物,最稳定的做终态;这些都是优化工作..
如果用NEB,就插若干结构,注意插入结构的合理性,否则NEB难收敛甚至不收敛,设一下INCAR,算就是了,然后就是耐心等待结果.....
收敛后,对插入结构中能量最高的那个再算下频率,确认一下是否真的为过渡态.....

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5楼2012-09-19 18:00:34
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