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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP计算neb的步骤
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liu108

木虫 (正式写手)

[求助] VASP计算neb的步骤

给位同仁：
       本人正在学习vasp中NEB的计算，vasp为4.6版本，执行程序为vasp-vt。因为是新手，所以在计算步骤上还不是太了解，还望给位高手指点。我首先是做好了初态和终态，并用脚本nebmake.pl产生了5个构象，5个构象和两个初态终态的POSCAR被自动保存到了7个子文件夹中。接下来我在总目录下设置了INCAR， KPOINTS，POTCAR，运行vasp-vt进行计算。现在计算完了，但是接下来该怎么做呢？还有就是我之前所做的各个步骤有没有错呢？还请给位高手指点。
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会当凌绝顶，一览众山小。
1楼 2012-09-19 13:56:52
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛

NEB怎么来判断反应呢？我的反应物和生成物的结构怎么做呢？
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会当凌绝顶，一览众山小。
4楼2012-09-19 17:24:39
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-09-20 16:59:14
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛
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2楼2012-09-19 16:34:18
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liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛

嗯，是的，就是计算过渡态的，但是具体的步骤不是很清晰，不知道做的对不对，还望指点。
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会当凌绝顶，一览众山小。
3楼2012-09-19 16:52:34
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-20 16:59:35
liu108: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-09-21 08:51:14
liu108: 金币+10 2012-10-05 10:19:42
引用回帖:
4楼: Originally posted by liu108 at 2012-09-19 17:24:39
NEB怎么来判断反应呢？我的反应物和生成物的结构怎么做呢？...

根据活化能判断反应难易
测试反应物可能的吸附结构，最稳定者做初态；根据反应物猜测可能的生成物，最稳定的做终态；这些都是优化工作..
如果用NEB，就插若干结构，注意插入结构的合理性，否则NEB难收敛甚至不收敛，设一下INCAR，算就是了，然后就是耐心等待结果.....
收敛后，对插入结构中能量最高的那个再算下频率，确认一下是否真的为过渡态.....
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liu108
5楼2012-09-19 18:00:34
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