应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP计算neb的步骤
51/1返回列表
查看: 5924  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

liu108

木虫 (正式写手)

[求助] VASP计算neb的步骤

给位同仁：
       本人正在学习vasp中NEB的计算，vasp为4.6版本，执行程序为vasp-vt。因为是新手，所以在计算步骤上还不是太了解，还望给位高手指点。我首先是做好了初态和终态，并用脚本nebmake.pl产生了5个构象，5个构象和两个初态终态的POSCAR被自动保存到了7个子文件夹中。接下来我在总目录下设置了INCAR， KPOINTS，POTCAR，运行vasp-vt进行计算。现在计算完了，但是接下来该怎么做呢？还有就是我之前所做的各个步骤有没有错呢？还请给位高手指点。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

first principle 计算化学-辅助工具 soft study

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
会当凌绝顶，一览众山小。
1楼 2012-09-19 13:56:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛

嗯，是的，就是计算过渡态的，但是具体的步骤不是很清晰，不知道做的对不对，还望指点。
赞一下 回复此楼
会当凌绝顶，一览众山小。
3楼2012-09-19 16:52:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-09-20 16:59:14
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛
赞一下 回复此楼
2楼2012-09-19 16:34:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu108

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-19 16:34:18
你做NEB的目的是什么？不就是找个过渡态、算个能垒、判断反应或扩散的难易吗？最多再画个reaction path，不知道你还想干嘛

NEB怎么来判断反应呢？我的反应物和生成物的结构怎么做呢？
赞一下 回复此楼
会当凌绝顶，一览众山小。
4楼2012-09-19 17:24:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-09-20 16:59:35
liu108: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-09-21 08:51:14
liu108: 金币+10 2012-10-05 10:19:42
引用回帖:
4楼: Originally posted by liu108 at 2012-09-19 17:24:39
NEB怎么来判断反应呢？我的反应物和生成物的结构怎么做呢？...

根据活化能判断反应难易
测试反应物可能的吸附结构，最稳定者做初态；根据反应物猜测可能的生成物，最稳定的做终态；这些都是优化工作..
如果用NEB，就插若干结构，注意插入结构的合理性，否则NEB难收敛甚至不收敛，设一下INCAR，算就是了，然后就是耐心等待结果.....
收敛后，对插入结构中能量最高的那个再算下频率，确认一下是否真的为过渡态.....
赞一下(2人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

liu108
5楼2012-09-19 18:00:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[文学芳草园] 梦想 +4 myrtle 2026-08-26 4/200 2026-08-31 08:43 by 逸域隐帆
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭