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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 序列筛选
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

[求助] 序列筛选

各位，求助！我测序拿到几十条序列后，有什么快速的方法能够对其进行筛选，知道中间哪些序列是相同的，哪些是不同的？
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1楼 2012-09-16 21:45:48
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liuxiuaza

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

都可以啊，序列一样和不一样的会用不同的颜色区分
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7楼2012-09-18 08:33:46
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ysn5048

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+3 2012-09-18 08:52:02
个人认为最快速的方法就是利用软件进行序列比对了，推荐软件DANMAN或者Vector NTI
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有时候，一句话，可以改变未来
2楼2012-09-16 22:57:40
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biofuture

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+3 2012-09-18 08:52:26
很简单 两两比对就行了，用序列比对软件 算Needlmen距离， 或者你要看哪些序列式一模一样的话 ， 写个perl脚本 unique一下就可以了。 最简单的就是用blast对序列建库， 再用这些序列搜索库。
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年轻人就应该奋斗
3楼2012-09-17 00:11:36
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272401213

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+6, ★★★很有帮助 2012-09-18 08:52:50
给你这个网站！http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/multalin.html
只要把所有的序列粘进去~就好！很直观！
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YNWA
4楼2012-09-17 07:34:56
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