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zhouxw1987

铁虫 (初入文坛)

[求助] 用DNaseⅠ处理RNA中混有的DNA后续操作如何进行? 已有1人参与

用Trizol抽提水稻叶片RNA,电泳检测后发现有很多的DNA污染,打算用DNaseⅠ进行处理除去残留的DNA。DNaseⅠ说明书上说的是处理完后可以用RNA纯化试剂盒进行纯化(这个试剂盒实验室没有,所以不用该方法),或者加入一定量的EDTA终止反应并65℃加热10min,但这种方法会有残留有各种离子。现在我想问的是:这个EDTA是如何配制才能保证不含有RNase,同时残留的各种离子是否会对后续的反转录和RT-PCR有影响??或者可否不用EDTA,而直接将DNaseⅠ处理的RNA溶液80℃处理10min以便去除DNaseⅠ(网上显示该酶在80摄氏度处理10分钟后将永久灭活)。
请问大家是如何处理RNA中混有的DNA呢??谢谢各位了·····
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zhouxw1987

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-09-16 12:21:40
嗯.................
       是这样的,用EDTA终止法并加热,我们实验室一般不用,因为我们认为若是有一点残留RNAse的话,65度下10min是非常危险的。所以一般灭活法采用酚氯仿抽提两次,然后醇低温沉淀回收RNA。具 ...

谢谢,不过貌似这里面也有同一个问题,那就是3M的醋酸钠如何配制???这个应该也是要无RNase的吧???
6楼2012-09-16 15:36:46
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查看全部 17 个回答

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你买的专门去除DNA的试剂盒里就有啊!
持之以恒、永不放弃!
2楼2012-09-16 11:17:06
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流经验,热心应助 2012-09-17 13:56:02
嗯.................
       是这样的,用EDTA终止法并加热,我们实验室一般不用,因为我们认为若是有一点残留RNAse的话,65度下10min是非常危险的。所以一般灭活法采用酚氯仿抽提两次,然后醇低温沉淀回收RNA。具体使用方法请移步至:
       http://www.takara.com.cn/explain/B/D2270A.pdf
Let God do with it as He wills
3楼2012-09-16 12:21:40
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zhouxw1987

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-09-16 11:17:06
你买的专门去除DNA的试剂盒里就有啊!

里面没有EDTA,那个貌似要自己配的····
4楼2012-09-16 15:28:40
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