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雨璐花香

铜虫 (小有名气)

[求助] 建立系统发育树

我在NCBI上筛选到了同源性99%的序列，但建立的系统发育树却是这样的，可信度太低。这是什么原因呢？

系统发育树.png
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1楼2012-09-10 19:17:21
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genolab

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-09-12 16:00:22
雨璐花香: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-09-12 19:10:51
序列建树不是完全选择99%的序列进行建树。一般的如果是99%的序列建树，出来的图回事一个竖线。不会有你那么大的差异。

首先，你要确认你的下载的序列是否都是同一个5端-3端的序列。因为只有序列方向一直建的树才对。
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2012-09-12 09:50:41
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雨璐花香

铜虫 (小有名气)
A8 A11 A14 A15是我的样品
赞一下 回复此楼
2楼2012-09-10 19:18:13
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
相似度高，区分度就小
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-10 19:51:04
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 回帖置顶 2012-09-11 14:35:08
1949stone: MolEPI+1 2012-09-11 14:35:13
1.物种近缘，信息微点较少。
2.序列过短。
3.你使用的那种算方法希望指出。
4.是否找到合适的外群 。
5.具体你的研究内容和方向。
   以上这些都是基本问题，希望把这些情况都贴出来，大家一起分析。
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将相本无种★男儿当自强
4楼2012-09-11 10:55:40
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