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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 第一次用blast得到的结果，求大家帮帮解读
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eaeas12

禁虫 (初入文坛)
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1楼 2012-09-08 23:22:02
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merryyiyi

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励热心应助 2012-09-10 13:42:59
请问你这是将测序后的结果在NCBI上blast的情况吗？如果是的，那么对应比对到的数据库中的序列均为“鸭疫里默氏杆菌”的，测序结果显示为100%匹配。

建议再根据你当时设计引物时的预期序列，看是否与您设计时的区域一致，如果一致，那么证明您的实验是正确的。

此外，Query为你测序结果，sbjct为数据库中已有的数据。数字1-279之类的代表了碱基排列所在的位置。
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eaeas12
2楼2012-09-09 11:47:07
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eaeas12

禁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
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3楼2012-09-09 21:27:23
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merryyiyi

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by eaeas12 at 2012-09-09 21:27:23
这些我已经搞懂了，如何转换fasta格式啊...

你试试DnsP软件，将你的序列复制到txt文本，然后直接改文件名为fas；另外也可建议用FinchTV试试：http://www.geospiza.com/Products/finchtv.shtml
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4楼2012-09-10 06:25:08
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ymw7777

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以尝试一下 DNAStar 这个软件 很强大的！
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奋斗，只为高品质生活！
5楼2012-10-12 00:46:32
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小佳佳佳佳

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by merryyiyi at 2012-09-09 11:47:07
请问你这是将测序后的结果在NCBI上blast的情况吗？如果是的，那么对应比对到的数据库中的序列均为“鸭疫里默氏杆菌”的，测序结果显示为100%匹配。

建议再根据你当时设计引物时的预期序列，看是否与您设计时的区 ...

有的出来不全是一种来源，做表格统计时写哪一种呢
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6楼2014-12-10 16:46:36
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