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lixtong铜虫 (小有名气)
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[求助]
求助各前辈！一个基因的功能和进化如何进行研究？
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小弟今年刚刚上研一，老板现在给定了方向，做一个发育调控基因。前几天老板让我考虑一下如何对该基因的功能和进化进行研究？这几天在网上找了些资料，感觉还是有点茫然，请各位前辈给点指导和建议，万谢！！！！ [ Last edited by 1949stone on 2012-9-22 at 08:38 ] |
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jiangyinshen
木虫 (著名写手)
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- 虫号: 990634
- 注册: 2010-04-07
- 专业: 生殖生物学
2楼2012-09-22 03:17:36
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1.基因的亚细胞定位和时空(发育期或梯度药物处理浓度, 不同组织/器官)表达谱; 2.基因在转录水平的调控(可以通过genome walking PCR或通过已有的资源库寻找该基因的启动子等转录调控区域, 通过单杂交或ChIP等技术, 寻找该基因的转录调控蛋白) 3.细胞生化水平的功能研究(也就是蛋白蛋白作用复合体的寻找验证,具体方法有酵母双杂交, GST pulldown, co-IP, BRET, FRET, BiFc等等,对该基因的表达产物做一个细胞信号转导通路的定位) 4.gain-of-function & loss-of-function: 也就是分别在细胞和个体水平,做该基因的超表达和knockdown(或knockout), 从表型分析该基因的功能. 功能研究应从完整的分子-细胞-个体三个层次研究, 综合分析. 关于基因的表达和定位，可以这样去做： 1. mRNA水平检测基因表达：选择表达目的基因的组织/细胞（发育不同时期、机体不同部位、加处理因素...），提取RNA，反转录，做RT-PCR或real time RT-PCR，检测基因的表达情况/变化。 （或者以northern blot、Rnase protection assay方法，检测基因的mRNA表达情况/变化。） 2. 蛋白质水平检测基因表达：选择相应的组织/细胞，以Western blot、免疫组化（OR免疫荧光)检测目的蛋白的表达。 3. 检测目的蛋白的细胞定位：将目的基因克隆至带荧光标签（如GFP）的表达载体，在适合的模式细胞中表达，在活细胞中观察蛋白的细胞定位。 |
3楼2013-03-13 21:06:22