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qzhost

木虫 (小有名气)

[求助] 请教一个关于单点能校正的问题

各位前辈，小生的做的是反应机理的研究，先用的B3LYP做的构型优化和过渡态搜索等工作，找到了一些途径，感觉能垒太高，100多千卡。因此想尝试做单点能校正，看能不能把能垒降下来。但是体系太大，五六十个原子，以C、N为主，还有几个O、H原子，700多个基函数。MP4，6-31G**基组算了几天，没能算动。

因此在此请教各位前辈，关于单点能校正，有什么比较好的能够兼顾效率和精度的方法吗？像我这个这么大的体系，应该用什么方法比较合适呢？
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1楼 2012-08-11 22:32:23
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
对这种体系算势垒最划算的是M06-2X/6-311G(2d,p)，和氢关系不大的话去掉氢的极化也行。也可以考虑混合基组。
给MP4用6-31G**是没有意义的，没有足够的极化函数，高级别后HF方法还未必比同等基组下用性能一般的DFT更好。
追求高精度的话，MP4、CCSD之类在目前来说已经不是很好的选择，结合色散校正的双杂化泛函明显更划得来。
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10楼2012-08-15 03:13:00
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普通回帖

liqx

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qzhost: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-08-13 09:03:40
1. 既然用B3LYP做了结构，为什么不用B3LYP做频率呢，这个计算量不大。
2. 比MP4计算量小的又比较可靠的方法是CCSD; 如果CCSD计算量还大，就可以试试MP2, 实际上B3LYP通常认为和MP2（一般情况下计算量比B3LYP大一些）的精度相当（对结构和过渡态是否也是如此？）。还有一个途径是改用较小基组，如6-31G*。具体怎么操作，看楼主的需要了。
3. 我前几年做过过渡态和频率计算，那个时候DFT（包括B3LYP）做的过渡态和频率通常和实验差别比较大，不知道现在是否有新的泛函可以得到较为理想的结果。
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2楼2012-08-12 13:00:46
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qzhost

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liqx at 2012-08-12 13:00:46
1. 既然用B3LYP做了结构，为什么不用B3LYP做频率呢，这个计算量不大。
2. 比MP4计算量小的又比较可靠的方法是CCSD; 如果CCSD计算量还大，就可以试试MP2, 实际上B3LYP通常认为和MP2（一般情况下计算量比B3LYP大一些 ...

听说高方法配低基组没什么意义，请问CCSD用什么基组才有意义呢？
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3楼2012-08-13 09:03:28
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liqx

木虫 (正式写手)
6-31G**或者CC-pVDZ都可以。
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4楼2012-08-13 09:27:13
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dreamyeye

木虫 (著名写手)
为什么要做单点能校正呢？校正什么呢？b3lyp算出来的应该就是单点能吧，楼主是不是说零点能校正？
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5楼2012-08-14 19:14:59
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tudoudigua

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qzhost: 金币+2, ★有帮助 2012-08-15 15:59:20
五六十个原子，用mp2
肯定算不动

建议用b3lyp/6-311g(d)
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人生总是在习惯那些不习惯的习惯！
6楼2012-08-14 19:38:29
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qzhost

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by dreamyeye at 2012-08-14 19:14:59
为什么要做单点能校正呢？校正什么呢？b3lyp算出来的应该就是单点能吧，楼主是不是说零点能校正？

因为据说B3LYP算能量不准，有低估垫垒的问题，但实际上算得势垒已经很高了，大概在100多千卡，尽管如此，还是想换一种高精度的能量方法，看势垒是不是能低一些。。。
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7楼2012-08-14 22:09:03
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qzhost

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by tudoudigua at 2012-08-14 19:38:29
五六十个原子，用mp2
肯定算不动

建议用b3lyp/6-311g(d)

MP2只做OPT的话还是没问题的。。。频率算不了而已

更何况我还只是算单点能。。。

MP4算不动可以肯定了， MP3算到一半被莫名其妙被杀掉了，也基本放弃了
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8楼2012-08-14 22:11:14
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dreamyeye

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
qzhost: 金币+2 2012-08-15 15:59:27
建议可以换一些其他的泛函试试，b3lyp也“饱受诟病”，现在应该有一些表现更好的泛函了，时间应该比mp方法快的。
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9楼2012-08-14 22:32:32
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