24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1758  |  回复: 11

qzhost

木虫 (小有名气)

[求助] 请教一个关于单点能校正的问题

各位前辈,小生的做的是反应机理的研究,先用的B3LYP做的构型优化和过渡态搜索等工作,找到了一些途径,感觉能垒太高,100多千卡。因此想尝试做单点能校正,看能不能把能垒降下来。但是体系太大,五六十个原子,以C、N为主,还有几个O、H原子,700多个基函数。MP4,6-31G**基组算了几天,没能算动。

因此在此请教各位前辈,关于单点能校正,有什么比较好的能够兼顾效率和精度的方法吗?像我这个这么大的体系,应该用什么方法比较合适呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


对这种体系算势垒最划算的是M06-2X/6-311G(2d,p),和氢关系不大的话去掉氢的极化也行。也可以考虑混合基组。
给MP4用6-31G**是没有意义的,没有足够的极化函数,高级别后HF方法还未必比同等基组下用性能一般的DFT更好。
追求高精度的话,MP4、CCSD之类在目前来说已经不是很好的选择,结合色散校正的双杂化泛函明显更划得来。
10楼2012-08-15 03:13:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

liqx

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
qzhost: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-08-13 09:03:40
1. 既然用B3LYP做了结构,为什么不用B3LYP做频率呢,这个计算量不大。
2. 比MP4计算量小的又比较可靠的方法是CCSD; 如果CCSD计算量还大,就可以试试MP2, 实际上B3LYP通常认为和MP2(一般情况下计算量比B3LYP大一些)的精度相当(对结构和过渡态是否也是如此?)。还有一个途径是改用较小基组,如6-31G*。具体怎么操作,看楼主的需要了。
3. 我前几年做过过渡态和频率计算,那个时候DFT(包括B3LYP)做的过渡态和频率通常和实验差别比较大,不知道现在是否有新的泛函可以得到较为理想的结果。
2楼2012-08-12 13:00:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liqx at 2012-08-12 13:00:46
1. 既然用B3LYP做了结构,为什么不用B3LYP做频率呢,这个计算量不大。
2. 比MP4计算量小的又比较可靠的方法是CCSD; 如果CCSD计算量还大,就可以试试MP2, 实际上B3LYP通常认为和MP2(一般情况下计算量比B3LYP大一些 ...

听说高方法配低基组没什么意义,请问CCSD用什么基组才有意义呢?
3楼2012-08-13 09:03:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liqx

木虫 (正式写手)

6-31G**或者CC-pVDZ都可以。
4楼2012-08-13 09:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamyeye

木虫 (著名写手)

为什么要做单点能校正呢?校正什么呢?b3lyp算出来的应该就是单点能吧,楼主是不是说零点能校正?
5楼2012-08-14 19:14:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tudoudigua

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
qzhost: 金币+2, 有帮助 2012-08-15 15:59:20
五六十个原子,用mp2
肯定算不动

建议用b3lyp/6-311g(d)
人生总是在习惯那些不习惯的习惯!
6楼2012-08-14 19:38:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by dreamyeye at 2012-08-14 19:14:59
为什么要做单点能校正呢?校正什么呢?b3lyp算出来的应该就是单点能吧,楼主是不是说零点能校正?

因为据说B3LYP算能量不准,有低估垫垒的问题,但实际上算得势垒已经很高了,大概在100多千卡,尽管如此,还是想换一种高精度的能量方法,看势垒是不是能低一些。。。
7楼2012-08-14 22:09:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tudoudigua at 2012-08-14 19:38:29
五六十个原子,用mp2
肯定算不动

建议用b3lyp/6-311g(d)

MP2只做OPT的话还是没问题的。。。频率算不了而已

更何况我还只是算单点能。。。

MP4算不动可以肯定了, MP3算到一半被莫名其妙被杀掉了,也基本放弃了
8楼2012-08-14 22:11:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamyeye

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
qzhost: 金币+2 2012-08-15 15:59:27
建议可以换一些其他的泛函试试,b3lyp也“饱受诟病”,现在应该有一些表现更好的泛函了,时间应该比mp方法快的。
9楼2012-08-14 22:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qzhost 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 54/2700 2026-04-14 18:00 by lhj2009
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +9 河南农业大学-能 2026-04-14 9/450 2026-04-14 16:03 by Art1977
[考研] 279求调剂 +12 张番茄不炒蛋 2026-04-11 12/600 2026-04-14 15:38 by zs92450
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 一志愿西交机械专硕求调剂 +9 求上岸的小王 2026-04-10 9/450 2026-04-13 16:08 by jiangguiquan11
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +8 慕绝cc 2026-04-09 8/400 2026-04-13 14:08 by 张zhihao
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +12 emokidd 2026-04-08 13/650 2026-04-13 08:32 by lhj2009
[考研] 322求调剂,08工科 +4 今天是个小号 2026-04-08 4/200 2026-04-13 00:20 by baobaoye
[考研] 326求调剂 +6 Shansyn 2026-04-10 6/300 2026-04-12 09:46 by hammer3
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 调剂 +5 文道星台 2026-04-11 5/250 2026-04-11 15:01 by 凯凯要变帅
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 22408 366分,本科211,一志愿西工大 +4 Rubt 2026-04-09 4/200 2026-04-10 19:51 by chemisry
[考研] 298求调剂 +13 钉叮咚冬瓜 2026-04-09 13/650 2026-04-10 15:49 by jiajinhpu
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 13/650 2026-04-10 10:27 by liuhuiying09
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +3 LZH(等待调剂中 2026-04-09 3/150 2026-04-09 21:29 by wutongshun
[考研] 0860004 求调剂 309分 +6 Yin DY 2026-04-09 6/300 2026-04-09 10:19 by 啊李999
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
信息提示
请填处理意见