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celia2012铜虫 (小有名气)
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[求助]
揪心的菌落PCR已有2人参与
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几天挑选了单菌落，进行种属鉴定，做了17个菌落PCR，成功了11个，实验过程是：挑菌加入50微升无菌水，99度裂解5分钟，后冰浴五分钟，离心10分钟取上清液进行PCR,退火温度是55度，循环数35，25微升体系（加5微升模板） 后来继续挑选进行实验，问题不断，P出来的成功率低，不到一半，而且好多出现拖带现象，这在第一次实验中没出现过，后进行测序说是有杂合、结合现象，测序终止，立马心情受到影响了，做了大量的菌落PCR， 几天全浪费了~不知道是什么原因 1.由于我做的菌差异大，要一一摸条件好烦，有的浓度低了，有个又高了，难以控制，挑菌不知道挑多少合适 2.不知道做菌落PCR,是不是要将菌活化一下再挑，菌放在冰箱大概有20天了，菌放的时间长了是不是影响实验 3.退火温度如何确定，多少适合？是否循环数过高了 4.菌落PCR是否可靠？还是直接先提DNA适合？主要是我要做200个菌，提起来麻烦，现在看来菌落PCR也不简单？ 希望有经验的虫友们给点意见吧~万分感谢啊~纠结万恶的实验啊~  |
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2楼2012-08-09 17:50:37
celia2012
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 虫号: 1654655
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- 专业: 景观与区域生态学
3楼2012-08-09 19:09:49
4楼2012-08-09 19:25:59