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gongyiweimu

木虫 (著名写手)

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[求助] Linux系统下GMIN软件安装及使用

我下载GMIN的svn.tar.bz2文件，但是解压后没有发现是soft文件夹，不知道如何安装，求高手指点，要是用过GMIN的高手能指点一下就更好了！

GMIN软件的主页：http://www-wales.ch.cam.ac.uk/GMIN/

本人对linux系统使用很弱，以下是我所知道的tar.bz2源代码包安装方式：
1、找到相应的软件包，比如soft.tar.bz2，下载到本机某个目录；
2、打开一个终端，su -成root用户；
3、cd soft.tar.bz2所在的目录；
4、tar -xjvf soft.tar.bz2 //一般会生成一个soft目录
5、cd soft
6、./configure
7、make
8、make install

[ 来自科研家族木虫量化 ]

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远山飘渺或可登

1楼 2012-07-26 18:58:33

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tengh

木虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gkf高: 金币+4 2013-08-26 09:38:34
gongyiweimu: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢啦，要是早一年就好 2013-08-27 18:05:52

你可以按照下面这个说明来进行安装，但是要根据你自己的机器环境做些改动，步骤其实就两步，cmake产生makefile文件，然后再make即可。

Compilation with cmake
======================
With cmake, the build is done in a separate directory from the source.

1. Make a build directory (typically GMIN/bin/build).

2. From within that directory, tell cmake what to compile

  $ cmake /path/to/source

3. Build GMIN using the automatically generated Makefile

  $ make -j

The -j flag does the compilation in parallel

Changing options
----------------
You can use the in-terminal gui ccmake to adjust all compilation options.
This includes which target executables to make (e.g. amber, charmm)

From whithin the build directory

  $ ccmake .

You may need to redo the cmake setup

  $ cmake .

choosing the fortran compiler
-----------------------------
To select the portland group fortran compiler the cmake build command is
modified like

  $ FC=pgf90 cmake /path/to/source/

Compiling with MPI
------------------
The MPI compilation with cmake currently only works with pgi (I think).
The command to build with MPI is a bit daft, but this is what works.
You need to specify the mpi compiler, you need to turn on the MPI precompiler
flag (this really aught to be done automatically), and you need to tell cmake
which mpi compiler to use (becuase they are all called mpif90).

  $ FC=mpif90 cmake /path/to/source/ -DWITH_MPI=true -DCOMPILER_SWITCH=pgi