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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 偏分离的效应问题
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tangzx998

银虫 (小有名气)

[求助] 偏分离的效应问题

在试验群体上，如F2群体，标记会发生偏分离的现象，大部分的时候我们测验一下是不是符合孟德尔比例就可以，我的问题是，偏分离的位点效应怎么度量。注意，不是偏分离位点对表型的效应，是位点自身对偏分离的效应。

我看到有的文章说偏离孟德尔比例的程度可以作为偏分离效应的度量，但是这个程度怎么量化呢?
各位有什么高见？请多多指导
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1楼 2012-07-25 09:52:26
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tangzx998

银虫 (小有名气)
tangzx998: 回帖置顶 2012-07-29 22:08:25
自己顶一下，啊有那个高人知道啊
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2楼2012-07-25 19:30:18
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

【答案】应助回帖

★ ★
tangzx998: 回帖置顶 2012-07-29 22:08:19
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-30 13:38:33
看你是什么群体
RIL 每个标记的理论分离比为1:1, 做卡方检验,可得到每个标记是否符合1:1的分离比
F2 理论比为11,也可以做卡方检验
用SPSS的非参数检验可一次算出所有的Marker
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奋斗是我们前进的动力！
3楼2012-07-29 16:26:25
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-30 13:38:43
你要统计a有多少，b有多少，用Excel中countif条件统计 countif（range，a）就能统计出a有多少个，b有多少个。
每个单株的任一标记的基因型必须要自己跑胶自己亲自读的，我们以前做的是136个RIL，800个SSR加EST标记！
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奋斗是我们前进的动力！
4楼2012-07-29 16:27:15
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tangzx998

银虫 (小有名气)
谢谢，你说的我都能够做出来，我问题的重点在如何度量偏离的程度？
我的群体是F2
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5楼2012-07-29 22:07:50
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

【答案】应助回帖

你采用SPSS，在网上找到偏分离操作的相关论文，然后按论文操作就可以
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奋斗是我们前进的动力！
6楼2012-07-30 13:42:54
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tangzx998

银虫 (小有名气)
软件都不是问题，卡方分析我也能做，我用SAS，几百个标记，几秒就能做完。我问题的重点是如何量化偏分离的程度，比如偏分离（1）1:2:3 ；偏分离（2）0:2:3，显然后一个偏分离更严重，如何用一个参数量化这种偏分离的程度？？
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7楼2012-07-31 15:37:27
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