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5kb大片段PCR扩增求助
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yuqin1987
新虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
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帖子: 11
在线: 3.5小时
虫号: 820495
注册: 2009-08-02
专业: 环境生物物理
[
求助
]
5kb大片段PCR扩增求助
我用细菌DNA为模版扩增一5kb片段,用的TAKARA的PrimeSTAR HS DNA Polymerase,反应条件98℃ 5min,98℃ 45s(变性),56℃ 20s(退火),68℃ 5min(延伸),68℃ 8min。扩出来的条带很暗,浓度很低,无法用于后续实验,求助各位高手,多多指教!
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1楼
2012-07-23 09:56:38
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gelois
金虫
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应助: 59
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性别:
MM
专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
建议围绕TM值设计温度梯度PCR,延伸时间可以适当再延长1min。
建议反应条件:
98℃ 5min
98℃ 45s
温度梯度 20s
72℃ 6min
72℃ 10min
4℃ ——
25-30个循环。
温度梯度PCR之后选几个结果较好的切胶回收。如果一直都是这样,浓度很低,可以多P几管,回收的时候合在一起应该就够用了。
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8楼
2012-07-25 11:22:25
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yixuanwin
铁杆木虫
(正式写手)
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在线: 40.2小时
虫号: 719137
注册: 2009-03-10
性别: GG
专业: 基因组学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+5, BioEPI+1, 应助指数+1, 谢谢参与
2012-07-25 16:29:27
1 使用高纯度的dNTP
2 做梯度试试
3 最后一步延伸时间增加到20min以上。
4 体系选择50 微,稳定性比20微好很多。
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2楼
2012-07-24 14:22:51
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love_st
金虫
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注册: 2009-04-08
性别: GG
专业: 系统生物学
不如重新设计引物
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3楼
2012-07-24 16:34:24
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克隆大虾
铁杆木虫
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专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
transgene fastpfu,72度延伸5Min,应该可以搞定
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4楼
2012-07-24 22:14:34
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