24小时热门版块排行榜    

查看: 1131  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

vetszh1181

银虫 (小有名气)

[求助] 有高人吗?基因序列预测分析

有高人吗?我要做一个鸡上的基因,但这个基因在GENEBANK上还没有参考序列,只有人和小鼠的,还有几种其它动物,但它们的序列相似性较低,使用人的mRNA序列和鸡的基因组序列BLAST也找不到匹配区域,我应该怎么分析预测这一基因的序列啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你连这个基因的序列都不知道,你怎么知道它与人和小鼠的相似性低?建议你在NCBI上找这个基因,而不是找鸡这个种属,然后比对一下目前已知的物种在这个基因上的相似性
8楼2012-07-23 18:45:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

凤凰-涅磐

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
上中国知网百度一篇类似的文章,借鉴别人的方法,要学会随机应变,这是自学的基础
吃得苦中苦,方为人上人
2楼2012-07-22 20:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-23 15:51:12
鸡的基因组已经测得差不多了吧,est序列电子克隆试过没?如果没办法,先找动物,特别是鸟类,比如鸭之类的相似基因,看看蛋白质保守区氨基酸序列是什么情况,试试简并引物和Oligo-dT做RT-PCR。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

为什么
3楼2012-07-22 20:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vetszh1181

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 547star at 2012-07-22 20:52:54
鸡的基因组已经测得差不多了吧,est序列电子克隆试过没?如果没办法,先找动物,特别是鸟类,比如鸭之类的相似基因,看看蛋白质保守区氨基酸序列是什么情况,试试简并引物和Oligo-dT做RT-PCR。

关键就是找不到鸟类的相似基因,根据人、鼠的相似基因设计简并引物跑出一段序列和人、鼠完全没有相似性
4楼2012-07-22 21:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 听说今天filecode变了 +25 布布和一二 2026-08-06 48/2400 2026-08-11 11:37 by since—2010
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 17/850 2026-08-11 10:50 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +6 Tide man 2026-08-10 6/300 2026-08-11 09:45 by tangmnt
[基金申请] 帮忙看看fileCode +6 wwncly 2026-08-10 11/550 2026-08-11 09:14 by xiaruohan
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
请填处理意见