24小时热门版块排行榜    

查看: 1140  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

vetszh1181

银虫 (小有名气)

[求助] 有高人吗?基因序列预测分析

有高人吗?我要做一个鸡上的基因,但这个基因在GENEBANK上还没有参考序列,只有人和小鼠的,还有几种其它动物,但它们的序列相似性较低,使用人的mRNA序列和鸡的基因组序列BLAST也找不到匹配区域,我应该怎么分析预测这一基因的序列啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yfsyp

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果经费比较充足,可以试试用找到的人或鼠或同类的物种随机进行引物设计
6楼2012-07-23 13:44:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

凤凰-涅磐

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
上中国知网百度一篇类似的文章,借鉴别人的方法,要学会随机应变,这是自学的基础
吃得苦中苦,方为人上人
2楼2012-07-22 20:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-23 15:51:12
鸡的基因组已经测得差不多了吧,est序列电子克隆试过没?如果没办法,先找动物,特别是鸟类,比如鸭之类的相似基因,看看蛋白质保守区氨基酸序列是什么情况,试试简并引物和Oligo-dT做RT-PCR。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

为什么
3楼2012-07-22 20:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vetszh1181

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 547star at 2012-07-22 20:52:54
鸡的基因组已经测得差不多了吧,est序列电子克隆试过没?如果没办法,先找动物,特别是鸟类,比如鸭之类的相似基因,看看蛋白质保守区氨基酸序列是什么情况,试试简并引物和Oligo-dT做RT-PCR。

关键就是找不到鸟类的相似基因,根据人、鼠的相似基因设计简并引物跑出一段序列和人、鼠完全没有相似性
4楼2012-07-22 21:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +6 majunge000 2026-08-10 6/300 2026-08-12 20:43 by JChen2024
[基金申请] 不应该看fileCode +5 且听虎啸 2026-08-12 6/300 2026-08-12 16:26 by Tide man
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
信息提示
请填处理意见