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chjinzhi

银虫 (正式写手)

[求助] 关于利用融合PCR技术进行点突变的问题 已有3人参与

各位大侠,我现在在做融合PCR以实现酶切位点的点突变,但我做了将近半年仍做不出结果,急需要大家的帮助!
我的扩增片段总共1400bp左右,扩增片段一个390bp左右,一个1100bp左右,两片段有23bp的重叠。重叠时总是扩增出小片段,不能得到目的片段!重叠时的温度我从62度到35度都做了一遍。但都没有目的片段。
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biology-girl

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这个时候我觉得你需要跟换引物了,因为引物是非常重要的。
2楼2014-07-23 11:49:07
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usky_4

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

有可能出问题的地方很多,信息不太全只能稍微猜测一下:
1. 酶。基因片段超过1kbp的话最好用好一些的酶,普通的taq酶估计很难做出来
2. 模板纯度。你的两个片段重叠时需要保证片段的纯度都比较高,而且片段浓度要一致,不能相差太多。
3. 延伸时间,可以试着延长延伸时间,重叠pcr的阅读速度比一般pcr要慢些

暂时想到这么多。

不过如果你是做点突变的话,应该就是要把一个基因片段中的一个酶切位点突变吧?如果只是一个基因片段完全没必要做融合pcr,可以直接用普通pcr做点突变.
-将你的目的基因连在小体积载体上
-设计一对完全互补的引物覆盖你要突变,扩增整个载体,当然这里需要特殊的聚合酶,可以扩增几kbp的大片段
-酶处理降解模板载体,只留下扩增产物,即已点突变的载体
-转染感受态,涂板,挑菌落,提质粒,测序
实验方案不超过两天,加上测序最多也就一周。而且不少试剂盒可以做点突变。
下次再见面的时候,我们一定会笑着相遇吧
3楼2014-07-24 03:58:54
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


【答案】应助回帖

如果是想在局部酶切位点的突变,用quikchange site directed mutagenesis不是马上就解决了吗?
4楼2014-07-24 04:31:14
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