| 查看: 10029 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
cashehe木虫 (职业作家)
|
[求助]
请问如何将这些序列转化为FASTA格式？
|
||
|
老板要求： 根据已经查到的相关的十几个基因的序列，通过NIBC Blast找到相似度较大的序列，一律转换为FASTA的格式。 我在网上查了，这是NIBC的举例： >gi|129295|sp|P01013|OVAX_CHICK GENE X PROTEIN (OVALBUMIN-RELATED) QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAEKMKILELPFASGDLSMLVLLPDEVSDLERIEKTINFEKLTEWTNPNTMEKRRVKVYLPQMKIEEKYNLTSVLMALGMTDLFIPSANLTGISSAESLKISQAVHGAFMELSEDGIEMAGSTGVIEDIKHSPESEQFRADHPFLFLIKHNPTNTIVYFGRYWSP 但我在Blast后筛选到的基因序列中却看不到这样的格式，只看到截图的结果，以及下面的结果： ORIGIN 1 tcaggcaaaa ctcctcagat agtcgggctc ggtactccag ctgatgcacg aaaccgggca 61 gacatcaatg gcaccatgtt ggatatcgtc ctcggatgcg ccattggggt cgtaacactc 121 cgccttgttt tcgtcatcga aacgaaacac ctcggaaacg ttgtccacgc agagcccgca 181 gcttatgcat tcttccttgt caatccatgg tgccttgatc at 请问如何转换为FASTA格式呢？ 给予最简明扼要但又清晰的回答的给予50分的重奖。只回答“见百度”“google一下”或给个网址的视为无效答案，呵呵。   |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有151人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何将XRD的raw文件转换成txt
已经有4人回复
- 求将多条核酸序列转化为氨基酸序列的方法或软件使用过程
已经有6人回复
- 关于蛋白酶特异性断裂氨基酸序列的问题
已经有4人回复
- 如何查LKB1编码的氨基酸序列
已经有5人回复
- 如何把一个氨基酸序列转化成FASTA格式
已经有7人回复
- 下载的SRA数据，如何自己用？转换成fasta格式呢？
已经有9人回复
- 上有核酸，下有氨基酸序列的图片如何做
已经有9人回复
- 如何找到所有蛋白质的AA序列
已经有6人回复
- 为什么我使用Bioedit不能保存为fasta格式？
已经有6人回复
- 如何处理大量的fasta格式的rna序列
已经有16人回复
- 咋办呢？基金交上去了，突然想起来图片是wmf格式没转成jpg格式
已经有11人回复
- 菜鸟求助——着急求助解答：在NCBI上为什么下载不了FASTA格式的基因序列
已经有9人回复
- 求助E.coli BL系列的全基因序列！
已经有14人回复
- FASTA 格式转换为TXT?
已经有4人回复
- 【原创】原创之七：【图文】系统进化树的构建及编辑【已搜索无重复】
已经有377人回复
- 【原创】mega建树方法
已经有225人回复
- 【求助/交流】mega 4.0 格式的转化
已经有3人回复
- 【求助/交流】有登陆号，如何批量从Genbank中导出fasta格式的核酸序列
已经有6人回复
- 【求助/交流】关于序列的MAF和BED格式
已经有5人回复
- 如何将序列转换为FASTA格式？
已经有11人回复
tupac225
金虫 (正式写手)
- MolEPI: 5
- 应助: 103 (高中生)
- 金币: 1967.9
- 散金: 20
- 红花: 4
- 帖子: 460
- 在线: 175.3小时
- 虫号: 1533370
- 注册: 2011-12-11
- 性别: GG
- 专业: 免疫生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cashehe: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 谢谢，帮了大忙 2012-07-20 14:53:37
感谢参与，应助指数 +1
cashehe: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 谢谢，帮了大忙 2012-07-20 14:53:37
|
我来举个例子。都在附件中 新建 Microsoft Office PowerPoint 演示文稿.pptx http://kuai.xunlei.com/d/GCGWREHSZENE?p=130497 |
3楼2012-07-20 08:50:59
2楼2012-07-20 01:14:41
4楼2012-07-20 11:30:58
tupac225
金虫 (正式写手)
- MolEPI: 5
- 应助: 103 (高中生)
- 金币: 1967.9
- 散金: 20
- 红花: 4
- 帖子: 460
- 在线: 175.3小时
- 虫号: 1533370
- 注册: 2011-12-11
- 性别: GG
- 专业: 免疫生物学
5楼2012-07-20 15:00:00