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wy135033405

木虫 (小有名气)

[求助] 无模板pcr合成短片段 一直失败

在下需要合成的片段为107bp,为了节省开支,设计了6条短引物,以数字大致表示如下(一条链的5' 端为起点,互补链也从该方向计数,加' 表示):

p1: 1-30  p2:15'-45'  p3: 31-60 p4: 46'-75'  p5: 60-90 p6: 76'-107'

如图

6条引物去除重叠部分可以拼凑成目的片段,目前使用多种酶、体系、反应条件均无法p出目的片段,在不重新设计引物的条件下,请大家提供些意见。本帖只为求助,如果确实通过您的方案做出结果,另赠100金币,绝不食言。

图示
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wy135033405: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-17 11:35:30
还是坚持继续PCR吧,实不相瞒,我刚进研一的时候,主要上课,老板让我练手,做了一个32段的,整整P了2个月才将条件确定了。因为那时的PCR仪器只有最简单的,什么梯度,降落都没有。最后就苦闷了2个月才OK。个人建议降低退火温度,延长退火时间试试看。
12楼2012-07-17 09:07:02
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
13楼: Originally posted by wy135033405 at 2012-07-17 09:27:11
十分感谢,我这个一比就小儿科了啊,32段,您老板也是奇葩……...

呵呵,做过了就还好,一起共勉。
14楼2012-07-17 10:07:09
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