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看天

木虫 (知名作家)

[交流] 如何做表达芯片分析

我的菌株没做全基因组测序，但是同一种菌的模式菌株的全基因组测序早已完成，并且有相关的商品化芯片，我能直接用于我自己菌株的基因表达分析吗？
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1楼 2012-07-12 21:54:27
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
看天(金币+1): 谢谢参与
不懂，学习哦~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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2楼2012-07-12 22:24:20
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huiquan0918

捐助贵宾 (职业作家)
★
看天(金币+1): 谢谢参与
学期~
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4楼2012-07-12 23:02:27
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)
★
看天(金币+1): 谢谢参与
表达分析有两种方法：芯片和RNA-seq。测序的方法可以不需要基因组序列，一般一个月就可以下机，加上后期数据分析，2个月足矣。
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6楼2012-07-13 06:35:39
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char0523

铁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
看天(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+3, 我没测 啊 2012-07-13 18:54:51
得做了基因组测序才能跟芯片结合来分析吧，芯片在医学疾病领域应用比较广泛！
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14楼2012-07-13 10:48:33
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eulota

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
看天(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+3, 我没测序 借用模式菌株的芯片做表达谱分析可以吗 2012-07-13 18:56:53
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-14 17:24:25
可以咨询一下测序公司，会有很好的解释。
现在一般是RNA-seq, 如果你只是想知道那些基因表达升高了，只需要提供对照和你的菌株样品；如果你想要知道你菌株中那些转录本发生了变化，则需要做拼接分析，拼接分析公司也可以给你做。
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16楼2012-07-13 17:32:10
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goingabroad3楼
2012-07-12 22:44   回复  
看天(金币+1): 谢谢参与
haixing20085楼
2012-07-12 23:20   回复  
看天(金币+1): 谢谢参与
祝福祝福
neu2347楼
2012-07-13 07:25   回复  
看天(金币+1): 谢谢参与
郑克宁8楼
2012-07-13 08:06   回复  
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留级生20059楼
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2008xuxy10楼
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秋之落叶11楼
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luojinyan12楼
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webmasterone75213楼
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看天15楼
2012-07-13 11:38   回复  
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