24小时热门版块排行榜    

查看: 3890  |  回复: 28
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

real-gold

银虫 (小有名气)


[交流] 文献上的引物可信度有多少

今天在查阅一篇文献对里面的内容有疑惑,文献原文如何下,
摘抄一条引物序列为:上游引物:5‘TTGTTGGAGAGACTGGCAAGACGG 3’
                    下游引物:5‘TGTCTTTTACCGTGATTTTCC3’
  我在ncbi在blast的结果如下
产物为2314,但文献上确写的是343,这该如何解释?文章上引物是不是出错了?
PS:经常发现是一些文献上的引物序列无法blast出结果。










[ Last edited by real-gold on 2012-7-12 at 19:53 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yilunanxia

金虫 (正式写手)



real-gold(金币+1): 谢谢参与
额,一般我直接从SCI里面找相关的引物序列,有时候懒得做梯度PCR的时候就直接拿文献上的条件用了,也没啥问题。
29楼2013-04-25 08:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 29 个回答

elbo

金虫 (小有名气)



real-gold(金币+1): 谢谢参与
看这个杂志怎么样,有的杂志一般,编辑的时候也可能疏忽,国内一级学报还是可信高的,多看几篇,看大家是否都用这个引物。
2楼2012-07-13 18:44:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

murphyLW

木虫 (正式写手)



real-gold(金币+1): 谢谢参与
文献上的一般比对下就知道了,行就用不行就换一个
8楼2012-07-13 19:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

real-gold(金币+1): 谢谢参与
一般就是引物好与不好的问题,不会有大差错的。
你blast出来的那个结果是基因组序列,而文献是用cDNA做的定量,可能中间有内含子,所以从基因组DNA和cDNA扩增出来的产物会有不同的大小。
你看看blast的结果里面有没有从cDNA或者mRNA(NM开头的编号)得到的片段,那个的大小应该就对了。
最好是自己把基因的序列找出来看看是不是有内含子吧。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2012-07-13 20:47:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 +8 妮妮ninicgb 2026-03-15 12/600 2026-03-19 05:55 by anny19840123
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +7 步川酷紫123 2026-03-13 7/350 2026-03-18 17:12 by 尽舜尧1
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 302求调剂 +10 呼呼呼。。。。 2026-03-17 10/500 2026-03-18 12:45 by Linda Hu
[考研] 299求调剂 +5 △小透明* 2026-03-17 5/250 2026-03-18 11:49 by 尽舜尧1
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +6 困于星晨 2026-03-17 6/300 2026-03-18 10:21 by kkcoco25
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 10/500 2026-03-17 15:07 by 一鸭鸭哟
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
信息提示
请填处理意见