应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 文献上的引物可信度有多少
51/1返回列表
查看: 4513  |  回复: 28
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

real-gold

银虫 (小有名气)

[交流] 文献上的引物可信度有多少

今天在查阅一篇文献对里面的内容有疑惑，文献原文如何下，
摘抄一条引物序列为：上游引物：5‘TTGTTGGAGAGACTGGCAAGACGG 3’
                    下游引物：5‘TGTCTTTTACCGTGATTTTCC3’
  我在ncbi在blast的结果如下
产物为2314，但文献上确写的是343，这该如何解释？文章上引物是不是出错了？
PS：经常发现是一些文献上的引物序列无法blast出结果。










[ Last edited by real-gold on 2012-7-12 at 19:53 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-07-12 19:51:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jl860822

金虫 (正式写手)
★
real-gold(金币+1): 谢谢参与
极有可能是中间有内含子，你再仔细看看
文献上的引物不一定好使，我上次从Nature上的一篇文献中照搬引物，结果扩增不出来，给那边老师发信，人家说了一堆PCR常见知识，后来果断换了引物
赞一下 回复此楼
24楼2012-07-15 12:14:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 29 个回答

elbo

金虫 (小有名气)
★
real-gold(金币+1): 谢谢参与
看这个杂志怎么样，有的杂志一般，编辑的时候也可能疏忽，国内一级学报还是可信高的，多看几篇，看大家是否都用这个引物。
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-13 18:44:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

murphyLW

木虫 (正式写手)
★
real-gold(金币+1): 谢谢参与
文献上的一般比对下就知道了，行就用不行就换一个
赞一下 回复此楼
8楼2012-07-13 19:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★
real-gold(金币+1): 谢谢参与
一般就是引物好与不好的问题，不会有大差错的。
你blast出来的那个结果是基因组序列，而文献是用cDNA做的定量，可能中间有内含子，所以从基因组DNA和cDNA扩增出来的产物会有不同的大小。
你看看blast的结果里面有没有从cDNA或者mRNA（NM开头的编号）得到的片段，那个的大小应该就对了。
最好是自己把基因的序列找出来看看是不是有内含子吧。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

real-gold
11楼2012-07-13 20:47:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 29 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭