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real-gold

银虫 (小有名气)

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[交流] 文献上的引物可信度有多少

今天在查阅一篇文献对里面的内容有疑惑，文献原文如何下，
摘抄一条引物序列为：上游引物：5‘TTGTTGGAGAGACTGGCAAGACGG 3’
下游引物：5‘TGTCTTTTACCGTGATTTTCC3’
我在ncbi在blast的结果如下
产物为2314，但文献上确写的是343，这该如何解释？文章上引物是不是出错了？
PS：经常发现是一些文献上的引物序列无法blast出结果。

[ Last edited by real-gold on 2012-7-12 at 19:53 ]

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1楼2012-07-12 19:51:28

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Rick001

铁杆木虫 (职业作家)

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★
real-gold(金币+1): 谢谢参与

多参考几篇文献，大家采用比较多的，一般是没大问题的。至于和Blast出来的结果不一样，我也遇到过。我并不知道为什么，我也是是生物科班，只是采用分子生物学手段对种群进行了分析。或许Blast出来的结果包含引物之外的序列。

如果参考文献很有限，那么该研究可能刚刚开始，可能有待于进一步的完善。

至于文献中提到的引物扩增片段长度对与否，合成一对引物，自己扩增以下，测序试一试就能证实了吧。

愚见，仅供参考！

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