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haolongmoon

银虫 (小有名气)

[求助] 怎样对已知其核酸序列的蛋白瘦身

各位大虾好,我们实验室以前构建的一个降解酶的工程菌,酶的分子量在30KD左右,老板现在想把这个酶的分子量再缩小点。思路是分析该控制该蛋白表达的DNA序列,希望能切除一些无用的片段,同时需要保证该酶的活性中心,希望有同学做过这方面类似工作的给点建议,能推荐相应的分析软件就更好了
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chlorella409

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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haolongmoon: 金币+5, 有帮助 2012-07-12 15:10:28
到NCBI上查出你的酶活性部位是哪边,把对应部位的基因克隆出来就可以了

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2楼2012-07-12 13:46:17
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haolongmoon

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chlorella409 at 2012-07-12 13:46:17
到NCBI上查出你的酶活性部位是哪边,把对应部位的基因克隆出来就可以了

我想问下,在NCBI上利用的是氨基酸的序列,还是核酸序列来查酶相应的活性部位,具体怎么操作,望指教,谢谢
假如生命是偶然的邂逅,那么死亡就是必然的分手!
3楼2012-07-12 15:10:12
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chlorella409

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

amisking: 回帖置顶 2012-07-12 21:52:15
输入蛋白序列之后结果中应该会有一系列的同源蛋白出处,你找最原始的,里面会列出蛋白肽段中各个片段代表的活性
4楼2012-07-12 21:33:20
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