应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 扩散系数模拟的结果比资料上的小一个数量级
51/1返回列表
查看: 4504  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yaneehan2010

银虫 (正式写手)

[交流] 扩散系数模拟的结果比资料上的小一个数量级

如题：我用MS进行分子扩散系数模拟时，结果比在手册上查的小一个数量级，这是为啥呀？请各位给予解答呀、、
另外，想请教一下，最终出来MSD曲线，那个直线段的斜率数值单位是埃^2/ps，除以6之后，是不是要进行单位换算呀，手册上是cm^2/s。
先行谢过呀、、
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

先进材料与分子模拟 感悟人生

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ytudou

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-07-10 22:42:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mailuoshan

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by yaneehan2010 at 2012-07-11 10:27:55
感谢回复呢，我先用了NPT，后来是NVE各跑了100000，MSD曲线我是取了拖尾前的那段近似直线的部分计算斜率。另外还用matlab将数据拟合了一条，这个单位换算是10^(-4)对吧。
我模拟的是298K，1atm时的情况，我建晶胞 ...

我想问一下用DL_POLY软件仿真得到的MSD数据是单个原子不同时刻的MSD,怎么把构成阳离子的不同原子的MSD等效成阳离子的MSD
赞一下 回复此楼
17楼2016-09-23 20:25:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

水晶蚂蚁

金虫 (小有名气)
★ ★
yaneehan2010(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-11 08:47:11
你的扩散系数模拟MSD 曲线是取得哪一段做为斜率？不同位置，数据不一样，单位换算肯定是要换算的，过程不麻烦。而且你的扩散系数与手册有差别也是正常的，你的计算设置也影响结果的，你做的是什么系综？
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-11 08:33:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaizhm

木虫 (著名写手)
★
yaneehan2010(金币+1): 谢谢参与
保证单位统一以后再计算
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-11 08:47:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaneehan2010

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 水晶蚂蚁 at 2012-07-11 08:33:58
你的扩散系数模拟MSD 曲线是取得哪一段做为斜率？不同位置，数据不一样，单位换算肯定是要换算的，过程不麻烦。而且你的扩散系数与手册有差别也是正常的，你的计算设置也影响结果的，你做的是什么系综？

感谢回复呢，我先用了NPT，后来是NVE各跑了100000，MSD曲线我是取了拖尾前的那段近似直线的部分计算斜率。另外还用matlab将数据拟合了一条，这个单位换算是10^(-4)对吧。
我模拟的是298K，1atm时的情况，我建晶胞以及以后的系综时，温度都写得是298K。密度我写的是其中一种分子在298K时的密度，这样设置有什么问题么？该怎么改呢？谢谢啦
赞一下 回复此楼
4楼2012-07-11 10:27:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +3 tannykie 2026-08-29 3/150 2026-08-29 16:18 by manplx
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 13:51 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +14 晴天加油 2026-08-26 15/750 2026-08-29 11:06 by biily
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +3 349506619 2026-08-28 3/150 2026-08-29 10:49 by 木风9012
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭