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luojin7653

银虫 (正式写手)

[求助] 对irc得到的结构是否可以（or 需要）作进一步结构优化？

本人现在找到需要的一个可能的过渡态结构（有关构型变化的），结构中虚频振动的方向与构型变化的趋势符合。
对该过渡态结构进行irc验证（正常结束），发现irc跑出的两端的化合物结构虽然有差异但变化不大，关键是未能得到两种预期的稳定构型（A和B）....
如果将反应物和产物取出重新进行结构优化，可以分别正常得到目标的稳定构型(A和B）。不知道这样做能否帮助确认我所找到的过渡态结构是否是可靠的呢？

P.s 结构中存在一个极易旋转的大基团，不知道是不是因为这个导致irc不能彻底跑到能量最低点
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今晚打老虎
1楼2012-07-08 21:15:06
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zhangji3013

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by luojin7653 at 2012-07-09 15:36:03
谢谢 能否给你金币呢...

不需要的，
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5楼2012-07-09 16:28:13
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
luojin7653: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢 那这样需不需要在文章中进行说明？我的步长和点数都做过了的 还是一样 其实我irc跑出来结构差异很小 就差个0.2-0.3 A 键长的样子 但我的稳定结构相差明显 大概有0.6-0.7个键长 2012-07-08 21:23:45
gmy1990: 金币+1 2012-07-08 21:56:18
luojin7653: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-07-09 19:13:17
我也这样干过，优化irc两边的结构，应该是可以的。
不过，你的irc可以加大步长，点数再做做
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喂人民服雾。
2楼2012-07-08 21:19:24
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zhangji3013

金虫 (小有名气)
有过一样的情况，增加点数，减小步长，但是irc跑不了几步就停了，结构跟TS很接近，甚至，键长相差不到0.1埃，取irc两边点做优化，没有得到极小值点，而是一个虚频的TS，但是优化时加opt=calcfc, 能走到想要的中间体。
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luojin7653
3楼2012-07-09 15:15:18
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luojin7653

银虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangji3013 at 2012-07-09 15:15:18
有过一样的情况，增加点数，减小步长，但是irc跑不了几步就停了，结构跟TS很接近，甚至，键长相差不到0.1埃，取irc两边点做优化，没有得到极小值点，而是一个虚频的TS，但是优化时加opt=calcfc, 能走到想要的中间体 ...

谢谢 能否给你金币呢
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今晚打老虎
4楼2012-07-09 15:36:03
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