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luojin7653

银虫 (正式写手)

[求助] 对irc得到的结构是否可以(or 需要)作进一步结构优化?

本人现在找到需要的一个可能的过渡态结构(有关构型变化的),结构中虚频振动的方向与构型变化的趋势符合。
对该过渡态结构进行irc验证(正常结束),发现irc跑出的两端的化合物结构虽然有差异但变化不大,关键是未能得到两种预期的稳定构型(A和B)....
如果将反应物和产物取出重新进行结构优化,可以分别正常得到目标的稳定构型(A和B)。不知道这样做能否帮助确认我所找到的过渡态结构是否是可靠的呢?

P.s 结构中存在一个极易旋转的大基团,不知道是不是因为这个导致irc不能彻底跑到能量最低点
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【答案】应助回帖

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luojin7653: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢 那这样需不需要在文章中进行说明?我的步长和点数都做过了的 还是一样 其实我irc跑出来结构差异很小 就差个0.2-0.3 A 键长的样子 但我的稳定结构相差明显 大概有0.6-0.7个键长 2012-07-08 21:23:45
gmy1990: 金币+1 2012-07-08 21:56:18
luojin7653: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-07-09 19:13:17
我也这样干过,优化irc两边的结构,应该是可以的。
不过,你的irc可以加大步长,点数再做做
喂人民服雾。
2楼2012-07-08 21:19:24
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