24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1575  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

[求助] vasp 集群并行出错

我的集群编译共两台机子,其中一台为主服务器(主机名:node1),另外一台作为客户端(node2),在并行编译过程中按照网上的编译方法都已经成功,包括机子之间访问无障碍,安装mpich2,启动mpd(单机+多机都成功),实现了服务器/home共享,在客户机挂载/home都没有问题,但一旦开始运行遇到两个问题:
1、用mpirun -np 4 ./cpi  命令的时候出现以下错误:
MPIR_Init_thread(188): Initialization failed
MPID_Init(118): channel initialization failed
MPIDI_CH3_Init(402): process not on the same host (node2 != node1)
rank 1 in job 1  scc-m_37184   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 1: return code 13
2、用mpiexec -machinefile  machinefile -n 4 ./cpi 出现以下错误:
invalid mpiexec argument -machinefile
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]
这里为什么-machinefile参数不存在呀????,另外使用-host参数的时候和没有用没什么区别。

还请高手指教那里出了问题。谢谢大家。困扰了很长时间了。谢谢大家。

[ Last edited by lightgjx on 2012-7-8 at 07:30 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 04nylxb at 2012-07-09 09:20:01
hydranodes,环境变量如何操作请google
第一个问题感觉是你mpi没有装好,你先用它自带的example试下,看看所有节点是否都跑通,mpi正常后,再调试vasp...

谢谢你的回复。所有节点都能独立运行。就是不能一起工作。本身测试的时候就是用的example里面的例子。弄不明白
7楼2012-07-09 12:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

snail594

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 多谢指教,鼓励交流! 2012-07-08 15:37:38
mpich2的参数应该是-f或者-file,你试试看,你这个是open-mpi的参数
Inlearningwetrust
2楼2012-07-08 10:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lightgjx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by snail594 at 2012-07-08 10:25:29
mpich2的参数应该是-f或者-file,你试试看,你这个是open-mpi的参数

还是不行:错误如下:
[nis@scc-m ~]$  mpiexec -f machinefile  -np 4 /home/nis/mpich20/examples/cpi
invalid mpiexec argument -f
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]

[nis@scc-m ~]$  mpiexec -file machinefile  -np 4 /home/nis/mpich20/examples/cpi
invalid mpiexec argument -file
Usage: mpiexec -n -soft -host \
               -wdir -path \
               -file -configfile execname \
               [ : -n ... execname ]
3楼2012-07-08 11:26:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

04nylxb

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用mpiexec的时候,要建立一个hydronodes的file,而不是machinefile,同时用把这个文件加到环境变量里面去。
集中精力发文章
4楼2012-07-08 20:46:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 0854调剂 +12 长弓傲 2026-04-09 13/650 2026-04-12 09:56 by 逆水乘风
[考研] 359求调剂 +5 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 19:55 by lbsjt
[考研] 352 求调剂 +6 yzion 2026-04-11 8/400 2026-04-11 16:24 by 明月此时有
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 一志愿沪9,326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 本科西工大 0856 324求调剂 +10 wysyjs25 2026-04-09 11/550 2026-04-10 08:37 by 5268321
[考研] 348求调剂 +3 candyyyi 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:20 by 段伟艳
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂,接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-08 3/150 2026-04-08 22:00 by zhouyuwinner
信息提示
请填处理意见